TrackSpecification: Difference between revisions

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</ImagingSession>                            |  -    |
</ImagingSession>                            |  -    |
<ListOfTracks>                              |  Y    | **** TRACK INFORMATION ****
<ListOfTracks>                              |  Y    | **** TRACK INFORMATION ****
   <NumberOfTracks>                           |  Y    | Number of tracks contained in the lineage
   <Track>                                   |  Y    | This block will repeat once per track in this collection
     327                                      |  -    |
     <TrackID>2</TrackID>                     |  n    | Id of the lineage that the track belongs to
  </NumberOfTracks>                         |  -    | 
     <LineageID>4</LineageID>                 |  n   |
  <Track>                                    |  Y    |
     <MotherTrackID>2</MotherTrackID>         |  n   |
    <TrackID>                               |  n    | Id of the lineage that the track belongs to
      2                                      |  -    |
    </TrackID>                              |  -    | 
     <LineageID>                             |  n    |
      0                                      |  -    |
    </LineageID>                             |  -   |
     <MotherTrackID>                         |  n    |
      2                                     |  -    |
    </MotherTrackID>                         |  -   |  
     <ListOfMeshes>                          |  Y    |    **** MESHES IN THIS TRACK ****
     <ListOfMeshes>                          |  Y    |    **** MESHES IN THIS TRACK ****
       <NumberOfMeshes>                       |  Y    | Number of meshes contained in the track
       <Mesh>                                 |  Y    | This block will repeat once for every mesh in this track
         23                                  |  -    |
         <MeshID>3</MeshID>                   |  n    |
      </NumberOfMeshes>                     |  -    |   
         <TCoord>0</TCoord>                   |  Y    | Time coordinate of the mesh
      <Mesh>                                |  Y    | **** MESH INFORMATIONS ****
        <MeshID>                             |  n   |
          3                                  |  -   |
         </MeshID>                           |  -    | 
        <TCoord>                             |  Y    | Time coordinate of the mesh
          0                                  |  -    |
        </TCoord>                            |  -    | 
         <Centroid>                          |  Y    | Spatial coordinate of the mesh's centroid
         <Centroid>                          |  Y    | Spatial coordinate of the mesh's centroid
           <X>114.4960</X>                  |  Y    | X coordinate
           <X>114.4960</X>                  |  Y    | X coordinate
Line 38: Line 22:
           <Z>66.7290>/Z>                    |  Y    | Z coordinate
           <Z>66.7290>/Z>                    |  Y    | Z coordinate
         </Centroid>                          |  -    |     
         </Centroid>                          |  -    |     
         <Volume>                             |  n    | Volume of mesh
         <Volume>537.92</Volume>             |  n   | Volume of mesh
          537.92                             |  -    |
         <Filename>0_1.vtk</Filename>        |  n    | Filename of the vtk file containing the geometry of the mesh
        </Volume>                           |  -   |  
         <Intensity>102</Intensity>          |  n    | average intensity  
         <Filename>                           |  n    | Filename of the vtk file containing the geometry of the mesh
          0_1.vtk                            |  -    |
        </Filename>                          |  -    | 
         <Intensity>                         |  n    | intensity informations
          <Channel>0</Channel>               |  n    |    - Channel
           <AverageValue>95.95</AverageValue> |  n    |     - Average corresponding intensity
        </Intensity>                        |  -    |
       </Mesh>                                |  -    |
       </Mesh>                                |  -    |
      <Mesh>...</Mesh>                      |  -    | additional meshes
     </ListOfMeshes>                          |  -    |
     </ListOfMeshes>                          |  -    |
   <Track>                                    |  -    |
   <Track>                                    |  -    |
  <Track>...</Track>                        |  -    | additional tracks
<ListOfTracks>                              |  -    |
<ListOfTracks>                              |  -    |


</pre>
</pre>

Revision as of 18:33, 25 July 2011

Specification for track file format

 XML TAGS                                    |REQUIRED| DESCRIPTION
<ImagingSession>                             |   n    | **** SESSION INFORMATION ****
  <HeaderFile>                               |   n    | Name of the MegaCapture File containing all the session information
    CaltechZebrafishSubsetData.meg           |   -    |  
  </HeaderFile>                              |   -    |
</ImagingSession>                            |   -    |
<ListOfTracks>                               |   Y    | **** TRACK INFORMATION ****
  <Track>                                    |   Y    | This block will repeat once per track in this collection
    <TrackID>2</TrackID>                     |   n    | Id of the lineage that the track belongs to
    <LineageID>4</LineageID>                 |   n    |
    <MotherTrackID>2</MotherTrackID>         |   n    |
    <ListOfMeshes>                           |   Y    |    **** MESHES IN THIS TRACK ****
      <Mesh>                                 |   Y    | This block will repeat once for every mesh in this track
        <MeshID>3</MeshID>                   |   n    |
        <TCoord>0</TCoord>                   |   Y    | Time coordinate of the mesh
        <Centroid>                           |   Y    | Spatial coordinate of the mesh's centroid
           <X>114.4960</X>                   |   Y    | X coordinate
           <Y>202.7230</Y>                   |   Y    | Y coordinate
           <Z>66.7290>/Z>                    |   Y    | Z coordinate
        </Centroid>                          |   -    |    
        <Volume>537.92</Volume>              |   n    | Volume of mesh
        <Filename>0_1.vtk</Filename>         |   n    | Filename of the vtk file containing the geometry of the mesh
        <Intensity>102</Intensity>           |   n    | average intensity 
      </Mesh>                                |   -    |
      <Mesh>...</Mesh>                       |   -    | additional meshes
    </ListOfMeshes>                          |   -    |
  <Track>                                    |   -    |
  <Track>...</Track>                         |   -    | additional tracks
<ListOfTracks>                               |   -    |
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