TrackSpecification: Difference between revisions

From KitwarePublic
Jump to navigationJump to search
Line 2: Line 2:
== Specification for track file format ==
== Specification for track file format ==
<pre>
<pre>
<ImagingSession>                            |  **** SESSION INFORMATIONS ****
 
HeaderFile CaltechZebrafishSubsetData.meg   |  Name of the megaFile containing all the session information
<ImagingSession>                            |  **** SESSION INFORMATION ****
  <HeaderFile>                              |
    CaltechZebrafishSubsetData.meg           |  Name of the megaFile containing all the session information
  </HeaderFile>                              |
</ImagingSession>                            |
</ImagingSession>                            |
NumberOfTracks 327                           |  Number of tracks contained in the lineage
<ListOfTracks>                              |
<Track>                                     |  **** TRACK INFORMATION ****
  <NumberOfTracks>                          |
LineageID 0                                  |    + Id of the lineage that the track belongs to
    327                                       |
<ListOfMeshes>                              |  **** GLOBAL MESH INFORMATIONS ****
  </NumberOfTracks>                          |  Number of tracks contained in the lineage
NumberOfMeshes 23                           |    + Number of meshes contained in the track
  <Track>    
<mesh>                                      |  **** MESH INFORMATIONS ****
    <TrackID>
TrackId 1                                    |    + Id of the track that the mesh belongs to '''Is it really required since they all belong to the same track?'''
      2
TCoord 0                                     |    + Time coordinate of the mesh
    </TrackID>                                |  **** TRACK INFORMATION ****
Centroid 114.4960 202.7230 66.7290          |    + Spatial coordinate of the mesh
    <LineageID>
Volume 537.92                                |    + Size of the mesh
      0
Filename 0_1.vtk                            |    + Corresponding .vtk file
    </LineageID>
<intensity>                                  |    + intensity informations
    <MotherTrackID>
Channel 0                                    |    - Channel
      2
AverageValue 95.95                         |    - Average corresponding intensity
    </MotherTrackID>                                 |    + Id of the lineage that the track belongs to
</intensity>                                |
    <ListOfMeshes>                              |  **** GLOBAL MESH INFORMATIONS ****
<intensity>                                  |    + intensity informations
      <NumberOfMeshes>
Channel 1                                    |    - Channel
        23    
AverageValue 185.76                          |    - Average corresponding intensity
      </NumberOfMeshes>                      |    + Number of meshes contained in the track
</intensity>                                 |
      <Mesh>
<intensity>                                  |    + intensity informations
        <MeshID>
Channel 2                                    |    - Channel
          3
AverageValue  0.00                          |    - Average corresponding intensity
        </MeshID>                                      |  **** MESH INFORMATIONS ****
</intensity>                                |
        <TCoord>
</mesh>                                      |
          0
<mesh>                                      |  **** MESH INFORMATIONS ****
        </TCoord>                                     |    + Time coordinate of the mesh
TrackId 2                                    |    + Id of the track that the mesh belongs to
        <Centroid>
...                                          |
          <X>114.4960</X>
</mesh>                                      |
          <Y>202.7230</Y>
...                                          |
          <Z>66.7290>/Z>
</ListOfMeshes>                             |
        </Centroid>           |    + Spatial coordinate of the mesh
...                                          |
        <Volume>
</Track>                                     |
          537.92
...                                          |
        </Volume>                               |    + Size of the mesh
<Track>                                     |
        <Filename>
...                                          |
          0_1.vtk
</Track>                                    |
        </Filename>                             |    + Corresponding .vtk file
        <Intensity>                                  |    + intensity informations
          <Channel>0</Channel>                                   |    - Channel
          <AverageValue>95.95</AverageValue>                         |    - Average corresponding intensity
        </Intensity>                                |
      </Mesh>                                      |
    </ListOfMeshes>
  <Track>    
<ListOfTracks>
 
</pre>
</pre>

Revision as of 16:01, 25 July 2011

Specification for track file format


<ImagingSession>                             |   **** SESSION INFORMATION ****
  <HeaderFile>                               |
    CaltechZebrafishSubsetData.meg           |   Name of the megaFile containing all the session information
  </HeaderFile>                              |
</ImagingSession>                            |
<ListOfTracks>                               |
  <NumberOfTracks>                           |
    327                                        |
  </NumberOfTracks>                          |   Number of tracks contained in the lineage
  <Track>     
    <TrackID>
      2
    </TrackID>                                 |   **** TRACK INFORMATION ****
    <LineageID>
      0
    </LineageID>
    <MotherTrackID>
      2
    </MotherTrackID>                                  |    + Id of the lineage that the track belongs to
    <ListOfMeshes>                               |   **** GLOBAL MESH INFORMATIONS ****
      <NumberOfMeshes>
        23     
      </NumberOfMeshes>                       |    + Number of meshes contained in the track
      <Mesh>
        <MeshID>
          3
        </MeshID>                                       |   **** MESH INFORMATIONS ****
        <TCoord>
          0
        </TCoord>                                     |    + Time coordinate of the mesh
        <Centroid>
           <X>114.4960</X>
           <Y>202.7230</Y>
           <Z>66.7290>/Z>
        </Centroid>           |    + Spatial coordinate of the mesh
        <Volume> 
          537.92
        </Volume>                                |    + Size of the mesh
        <Filename>
          0_1.vtk
        </Filename>                             |    + Corresponding .vtk file
        <Intensity>                                  |    + intensity informations
          <Channel>0</Channel>                                    |     - Channel
          <AverageValue>95.95</AverageValue>                         |     - Average corresponding intensity
        </Intensity>                                 |
      </Mesh>                                      |
    </ListOfMeshes>
  <Track>     
<ListOfTracks>
Retrieved from "https://public.kitware.com/Wiki/index.php?title=TrackSpecification&oldid=41845"