<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">Ah yes, that was also confusing to me in the beginning.<br>The CMake file includes a ggo file from the parent directory:<br><a href="https://github.com/SimonRit/RTK/blob/master/applications/rtkprojectgeometricphantom/CMakeLists.txt#L1">https://github.com/SimonRit/RTK/blob/master/applications/rtkprojectgeometricphantom/CMakeLists.txt#L1</a></div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr">This file has the volume property arguments, such as spacing:</div><div dir="ltr"><a href="https://github.com/SimonRit/RTK/blob/master/applications/rtk3Doutputimage_section.ggo">https://github.com/SimonRit/RTK/blob/master/applications/rtk3Doutputimage_section.ggo</a></div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr">/Andreas <br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><p style="margin-bottom:0.0001pt"><span lang="EN-US" style="color:rgb(31,73,125)"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;line-height:16.8667px;font-family:Calibri,sans-serif">__________________________________</span></span></p><p style="margin-bottom:0.0001pt"><span lang="EN-US" style="color:rgb(31,73,125)"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;line-height:16.8667px;font-family:Calibri,sans-serif">Andreas Gravgaard Andersen</span></span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Danish Center for Particle Therapy, </span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Aarhus University Hospital<u></u><u></u></span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span lang="DA" style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Palle Juul-Jensens Blvd. 99,</span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span lang="DA" style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">8200, Aarhus</span></p><div><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span lang="DA" style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Mail:     <a href="mailto:agravgaard@protonmail.com" target="_blank">agravgaard@protonmail.com</a></span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span style="color:rgb(31,73,125);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:11pt">Cell:     </span><span style="color:rgb(31,73,125);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:11pt"> </span><a value="+4523382411" style="font-family:Calibri,sans-serif;font-size:11pt;color:rgb(17,85,204)">+45 3165 8140</a></p></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, 18 May 2020 at 09:49, 나윤호 <<a href="mailto:yoonho94.na@gmail.com">yoonho94.na@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>Thank you for replying.</div><div><br></div>but there are no options about dimension and spacing in that <a href="https://github.com/SimonRit/RTK/blob/master/applications/rtkprojectgeometricphantom/rtkprojectgeometricphantom.ggo" target="_blank">ggo file</a>.<div><br></div><div>I can find other options though.</div><div><br></div><div>for example there's an script like this.</div><div><pre style="font-family:monospace,monospace;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(248,249,250);border:1px solid rgb(234,236,240);padding:1em;white-space:pre-wrap;line-height:1.3em;font-size:14px">rtkprojectgeometricphantom -g geometry.xml -o projections.mha --spacing <span style="color:rgb(102,102,102)">2</span> --dimension<span style="color:rgb(102,102,102)">=</span><span style="color:rgb(102,102,102)">512</span>,3,512 --phantomfile SheppLogan-2d.txt --phantomscale<span style="color:rgb(102,102,102)">=</span><span style="color:rgb(102,102,102)">256</span>,1,256</pre>and there's no options about spacing and dimension in the ggo file.</div><div><br></div><div>Yoonho.</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">2020년 5월 18일 (월) 오후 4:38, Andreas Andersen <<a href="mailto:andreasga22@gmail.com" target="_blank">andreasga22@gmail.com</a>>님이 작성:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">argv is an array of \0 terminated char arrays from the commandline -> i.e. or an array of strings.<div>E.g. "rtksimulatedgeometry -n 180 -o geometry.xml"</div><div>would give *argv = "rtksimulatedgeometry\0-n\0180\0-o\0geometry.xml\0"<br>such that argv[2] = "180" and argv[4] = "geometry.xml"<br><div>argc is the number of  strings in the array.</div><div><br></div><div>Gengetopt (GGO) handles the arguments for you and binds them to the args_info struct based on the *.ggo file.</div><div><br></div><div>I hope this makes it somewhat understandable.</div><div><br></div><div>/Andreas</div><div><br clear="all"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><p style="margin-bottom:0.0001pt"><span lang="EN-US" style="color:rgb(31,73,125)"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;line-height:16.8667px;font-family:Calibri,sans-serif">__________________________________</span></span></p><p style="margin-bottom:0.0001pt"><span lang="EN-US" style="color:rgb(31,73,125)"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;line-height:16.8667px;font-family:Calibri,sans-serif">Andreas Gravgaard Andersen</span></span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Danish Center for Particle Therapy, </span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Aarhus University Hospital<u></u><u></u></span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span lang="DA" style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Palle Juul-Jensens Blvd. 99,</span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span lang="DA" style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">8200, Aarhus</span></p><div><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span lang="DA" style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Mail:     <a href="mailto:agravgaard@protonmail.com" target="_blank">agravgaard@protonmail.com</a></span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black"><span style="color:rgb(31,73,125);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:11pt">Cell:     </span><span style="color:rgb(31,73,125);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:11pt"> </span><a value="+4523382411" style="font-family:Calibri,sans-serif;font-size:11pt;color:rgb(17,85,204)">+45 3165 8140</a></p></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div></div></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, 18 May 2020 at 08:43, 나윤호 <<a href="mailto:yoonho94.na@gmail.com" target="_blank">yoonho94.na@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi, rtk-users.<div><br></div><div>first I'm not really a C++ user<br><div><br></div><div>I'm looking on this <a href="http://wiki.openrtk.org/index.php/RTK/Scripts/FDK" target="_blank">link</a> and I'm curious about argv for dimension and spacing.</div><div><br></div><div>where does the spacing and dimension value go?</div><div><br></div><div>in the <span style="color:rgb(36,41,46);font-weight:600;font-size:16px;font-family:-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Helvetica,Arial,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji"">rtkprojectgeometricphantom.cxx, </span>I don't see any variables related to spacing and dimension argv.</div><div><br></div><div>I think there should be something like args_info.spacing or args_info.dimension.</div><div><br></div><div>where does argv for spacing and dimension goes to? </div></div><img width="0" height="0" alt="" style="display: flex;"></div>
_______________________________________________<br>
Rtk-users mailing list<br>
<a href="mailto:Rtk-users@public.kitware.com" target="_blank">Rtk-users@public.kitware.com</a><br>
<a href="https://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users</a><br>
</blockquote></div>
</blockquote></div><img width="0" height="0" alt="" style="display: flex;" src="https://mailtrack.io/trace/mail/bb6db5199e186b1f9e184c7ed8e87ac908ab04d0.png?u=4672561"></div>
</blockquote></div>