<div dir="ltr"><div><div><div>Hi Phuripan,<br><br></div>HDF5 is not a file format in itself, only Salvus tools will be able to manipulate it.<br></div>If you are not able to use the script, you should ask Salvus community for help.<br><br></div>Best,<br></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr">Mathieu Westphal<br></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Fri, Apr 27, 2018 at 1:49 PM, Phuripan Jangthongsiri <span dir="ltr"><<a href="mailto:bung_m105@hotmail.com" target="_blank">bung_m105@hotmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
Hi,</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
It's called Salvus. It's a software for Seismology. They have a command that: ! python ./petsc_gen_xdmf.py name_of_your_file.h5</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
and it should convert .h5 file to .xdmf but it doesn't work. I was wondering if there are any converters out there or any codes that I could run on python?</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
Cheers,</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
Phuripan</div>
<hr style="display:inline-block;width:98%">
<div id="m_5194804918761956107divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font style="font-size:11pt" face="Calibri, sans-serif" color="#000000"><b>From:</b> Mathieu Westphal <<a href="mailto:mathieu.westphal@kitware.com" target="_blank">mathieu.westphal@kitware.com</a>><br>
<b>Sent:</b> Friday, April 27, 2018 11:37 AM<div><div class="h5"><br>
<b>To:</b> Phuripan Jangthongsiri<br>
<b>Cc:</b> <a href="mailto:paraview@public.kitware.com" target="_blank">paraview@public.kitware.com</a><br>
<b>Subject:</b> Re: [Paraview] converting .h5 file</div></div></font>
<div> </div>
</div><div><div class="h5">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div>Hi Phuripan,<br>
<br>
</div>
Which software are you using to produce your .h5 files ?<br>
<br>
</div>
Best,<br>
</div>
<div class="m_5194804918761956107x_gmail_extra"><br clear="all">
<div>
<div class="m_5194804918761956107x_gmail_signature">
<div dir="ltr">Mathieu Westphal<br>
</div>
</div>
</div>
<br>
<div class="m_5194804918761956107x_gmail_quote">On Fri, Apr 27, 2018 at 12:09 PM, Phuripan Jangthongsiri
<span dir="ltr"><<a href="mailto:bung_m105@hotmail.com" target="_blank">bung_m105@hotmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="m_5194804918761956107x_gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
Hi there!</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
Thanks for your answers. I've been trying to find a way to convert .h5 file to xdmf file. Do you know the easiest way to do that?</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
Sincerely,</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
Phuripan Jangthongsiri</div>
<hr style="display:inline-block;width:98%">
<div id="m_5194804918761956107x_m_2594076658030557938divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font style="font-size:11pt" face="Calibri, sans-serif" color="#000000"><b>From:</b> Mathieu Westphal <<a href="mailto:mathieu.westphal@kitware.com" target="_blank">mathieu.westphal@kitware.com</a>><br>
<b>Sent:</b> Friday, April 27, 2018 9:09 AM<br>
<b>To:</b> Phuripan Jangthongsiri<br>
<b>Cc:</b> <a href="mailto:paraview@public.kitware.com" target="_blank">paraview@public.kitware.com</a><br>
<b>Subject:</b> Re: [Paraview] converting .h5 file</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div class="m_5194804918761956107x_h5">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div>Dear Phuripan,<br>
<br>
</div>
ParaView support some hdf5 based format already, so you may want to try that first, i've included a list a .h5 based format supported by ParaView natively.<br>
TRUCHAS dataset<br>
PDAL Files<br>
Chombo Files<br>
GTC Files<br>
UNIC Files<br>
VizSchema Files<br>
H5Nimrod Files<br>
Multilevel 3D Plasma Files<br>
PFLOTRAN Files<br>
Pixie Files<br>
Tetrad Files<br>
<br>
</div>
Please note that we also support Xdmf, H5Part and Enzo HDF5 format wich are using hdf5 as well.<br>
<div><br>
</div>
<div>Best regards,<br>
</div>
<div class="m_5194804918761956107x_m_2594076658030557938x_gmail_extra"><br clear="all">
<div>
<div class="m_5194804918761956107x_m_2594076658030557938x_gmail-m_834894622453424288gmail_signature">
<div dir="ltr">Mathieu Westphal<br>
</div>
</div>
</div>
<br>
<div class="m_5194804918761956107x_m_2594076658030557938x_gmail_quote">On Thu, Apr 26, 2018 at 5:02 PM, Phuripan Jangthongsiri
<span dir="ltr"><<a href="mailto:Bung_m105@hotmail.com" target="_blank">Bung_m105@hotmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="m_5194804918761956107x_m_2594076658030557938x_gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255)">
<span style="color:rgb(51,51,51);font-size:15px;font-style:normal;font-weight:400">Dear whom it may concern,</span><br style="font-size:15px">
<br style="font-size:15px">
<span style="color:rgb(51,51,51);font-size:15px;font-style:normal;font-weight:400">I'm having .h5 files for my simulations. I'm wondering if there are easy ways to convert those .h5 files to something that Paraview could read and what are types of files
 that are allowed on Paraview.</span><br style="font-size:15px">
<br style="font-size:15px">
<span style="color:rgb(51,51,51);font-size:15px;font-style:normal;font-weight:400">Sincerely,</span><br style="font-size:15px">
<span style="color:rgb(51,51,51);font-size:15px;font-style:normal;font-weight:400">Phuripan</span><br>
</div>
</div>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at <a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">
http://www.kitware.com/opensou<wbr>rce/opensource.html</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ParaView Wiki at: <a href="http://paraview.org/Wiki/ParaView" rel="noreferrer" target="_blank">
http://paraview.org/Wiki/ParaV<wbr>iew</a><br>
<br>
Search the list archives at: <a href="http://markmail.org/search/?q=ParaView" rel="noreferrer" target="_blank">
http://markmail.org/search/?q=<wbr>ParaView</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="https://public.kitware.com/mailman/listinfo/paraview" rel="noreferrer" target="_blank">https://public.kitware.com/mai<wbr>lman/listinfo/paraview</a><br>
<br>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div></div></div>

</blockquote></div><br></div>