<html>
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<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
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<body dir="ltr">
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Hello Stanislas,</div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Thank you for taking the time to answer and sorry for my mistake, I am using <span style="color: rgb(31, 73, 125); font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif, serif, EmojiFont">
</span><i><span style="color: black; font-family: Calibri, sans-serif, serif, EmojiFont">CSCGNW</span></i><span style="color: rgb(31, 73, 125); font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif, serif, EmojiFont"></span> bioluminescence, and the field I am
 referring to in NIRFAST is actually data_fn in the reconstruct_fl function. <br>
</div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<i><span>function [fwd_mesh,pj_error] = reconstruct_fl(fwd_mesh,...<br>
</span></i>
<div><i>    recon_basis,...<br>
</i></div>
<div><i>    frequency,...<br>
</i></div>
<div><i>    data_fn,...<br>
</i></div>
<div><i>    iteration,...<br>
</i></div>
<div><i>    lambda,...<br>
</i></div>
<div><i>    output_fn,...<br>
</i></div>
<i><span>    filter_n)</span></i></div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<i><span><br>
</span></i></div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<span>data_fn are the boundery data measured, and I wanted to know if we have to normalise these data in a specific way.</span><i><span><br>
</span></i></div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<i><span><br>
</span></i></div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<span>Thank you and regards,</span></div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<span><br>
</span></div>
<div style="font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<span>Emmanuel</span><br>
</div>
<div id="appendonsend"></div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font style="font-size:11pt" face="Calibri, sans-serif" color="#000000"><b>De :</b> Stanislaw Wojtkiewicz <s.wojtkiewicz@cs.bham.ac.uk><br>
<b>Envoyé :</b> mercredi 20 mars 2019 10:01<br>
<b>À :</b> emmanuel.cosnard@outlook.fr; nirfast@public.kitware.com<br>
<b>Objet :</b> RE: [Nirfast] Normalisation of the measurements?</font>
<div> </div>
</div>
<div lang="EN-GB">
<div class="x_WordSection1">
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif; color:#1F497D">Hi Emmanuel</span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif; color:#1F497D"> </span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif; color:#1F497D">It looks like the ‘</span><i><span style="font-family:"Calibri",sans-serif; color:black">CSCGNW</span></i><span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif; color:#1F497D">’
 function does not exist in NIRFAST.</span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif; color:#1F497D">Even Google knows nothing about it:)</span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif; color:#1F497D">Please, track down to whom this function belongs to.</span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif; color:#1F497D"> </span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif; color:#1F497D">Also, regardless of the existence of the function, I have a strong impression that the current question might be outside of the scope of this mailing list….</span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif; color:#1F497D"> </span></p>
<div>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:Consolas; color:#1F497D" lang="EN-US">Regards</span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:Consolas; color:#1F497D" lang="EN-US">Stanislaw Wojtkiewicz, PhD</span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:Consolas; color:#1F497D" lang="EN-US"> </span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:Consolas; color:#1F497D" lang="EN-US">---</span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:Consolas; color:#1F497D" lang="EN-US">School of Computer Science</span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:Consolas; color:#1F497D" lang="PL">University of Birmingham</span></p>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:Consolas; color:#1F497D" lang="PL">B15 2TT</span></p>
</div>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif; color:#1F497D"> </span></p>
<div>
<div style="border:none; border-top:solid #E1E1E1 1.0pt; padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<b><span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif" lang="EN-US">From:</span></b><span style="font-size:11.0pt; font-family:"Calibri",sans-serif" lang="EN-US"> emmanuel.cosnard@outlook.fr <emmanuel.cosnard@outlook.fr>
<br>
<b>Sent:</b> 20 March 2019 09:36<br>
<b>To:</b> nirfast@public.kitware.com<br>
<b>Subject:</b> [Nirfast] Normalisation of the measurements?</span></p>
</div>
</div>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
 </p>
<div>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-family:"Calibri",sans-serif; color:black">Hello,</span></p>
</div>
<div>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-family:"Calibri",sans-serif; color:black"> </span></p>
</div>
<div>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-family:"Calibri",sans-serif; color:black">I would like to know if we have to normalise our fluorescence measurements data in a specific way for the "measurements" vector transmitted in the CSCGNW function (<i>function [xFinal varargout] =
 CSCGNW(jacobianMatrix, measurements, recParam)</i>). </span></p>
</div>
<div>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-family:"Calibri",sans-serif; color:black">How do we take into account the time of exposure? Do the measures have to be between a specific range, or do we have to apply a specific function on it?</span></p>
</div>
<div>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-family:"Calibri",sans-serif; color:black"> </span></p>
</div>
<div>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-family:"Calibri",sans-serif; color:black">Thank you and regards,</span></p>
</div>
<div>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-family:"Calibri",sans-serif; color:black"> </span></p>
</div>
<div>
<p class="x_MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;">
<span style="font-family:"Calibri",sans-serif; color:black">Emmanuel</span></p>
</div>
</div>
<div id="x_DAB4FAD8-2DD7-40BB-A1B8-4E2AA1F9FDF2"><br>
<br>
<hr style="border:none; color:#909090; background-color:#B0B0B0; height:1px; width:99%">
<table style="border-collapse:collapse; border:none">
<tbody>
<tr>
<td style="border:none; padding:0px 15px 0px 8px"><a href="https://www.avast.com/antivirus"><img alt="Avast logo" border="0" src="http://static.avast.com/emails/avast-mail-stamp.png">
</a></td>
<td>
<p style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: "Times New Roman", serif;color:#3d4d5a; font-family:"Calibri","Verdana","Arial","Helvetica"; font-size:12pt">
This email has been checked for viruses by Avast antivirus software. <br>
<a href="https://www.avast.com/antivirus">www.avast.com</a> </p>
</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<br>
<a href="#x_DAB4FAD8-2DD7-40BB-A1B8-4E2AA1F9FDF2" width="1" height="1"></a></div>
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