<div dir="ltr"><div><div><div>Cory,<br><br></div>I'm sorry I don't know what you mean by local scratch space.<br><br></div>Thanks,<br><br></div>Andrew<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 12, 2017 at 10:55 AM, Cory Quammen <span dir="ltr"><<a href="mailto:cory.quammen@kitware.com" target="_blank">cory.quammen@kitware.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span class="">> I'm currently building on my school's servers.<br>
<br>
</span>Is there local scratch space on which you can build software on that<br>
server? My guess is you are building in a home directory that is on an<br>
AFS or NFS or some other network file system, and that is causing you<br>
problems.<br>
<br>
Thanks,<br>
Cory<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
> Thanks,<br>
> Andrew<br>
><br>
><br>
> On Wed, Apr 12, 2017 at 10:50 AM, Andrew Lam <<a href="mailto:werdna.mal222@gmail.com">werdna.mal222@gmail.com</a>><br>
> wrote:<br>
>><br>
>> Cory,<br>
>><br>
>> I'm currently building on my school's servers.<br>
>><br>
>> Thanks,<br>
>> Andrew<br>
>><br>
>> On Wed, Apr 12, 2017 at 10:47 AM, Cory Quammen <<a href="mailto:cory.quammen@kitware.com">cory.quammen@kitware.com</a>><br>
>> wrote:<br>
>>><br>
>>> Andrew,<br>
>>><br>
>>> Are you building on a networked file system of some sort? I've run<br>
>>> into issues long ago building software before when the file system and<br>
>>> computer have different ideas of what time it is.<br>
>>><br>
>>> - Cory<br>
>>><br>
>>> On Wed, Apr 12, 2017 at 1:29 PM, Andrew Lam <<a href="mailto:werdna.mal222@gmail.com">werdna.mal222@gmail.com</a>><br>
>>> wrote:<br>
>>> > Hi Andy,<br>
>>> ><br>
>>> > It's still not working. I made a fresh build directory and ran through<br>
>>> > the<br>
>>> > motions again. It still has the same issue. I've attached my<br>
>>> > CMakeCache.txt<br>
>>> > file from my build directory. Please let me know if you see anything or<br>
>>> > if<br>
>>> > there is any other information that you might think would help.<br>
>>> ><br>
>>> > Thanks,<br>
>>> > Andrew<br>
>>> ><br>
>>> > On Wed, Apr 12, 2017 at 8:43 AM, Andy Bauer <<a href="mailto:andy.bauer@kitware.com">andy.bauer@kitware.com</a>><br>
>>> > wrote:<br>
>>> >><br>
>>> >> Hi Andrew,<br>
>>> >><br>
>>> >> This should compile for you now. If it doesn't, please let us know and<br>
>>> >> we<br>
>>> >> can see how to get it working for you. If you do have problems I<br>
>>> >> recommend<br>
>>> >> attaching your CMakeCache.txt file from your build directory so it's<br>
>>> >> easier<br>
>>> >> for others to inspect what you did.<br>
>>> >><br>
>>> >> Best,<br>
>>> >> Andy<br>
>>> >><br>
>>> >> On Wed, Apr 12, 2017 at 11:12 AM, Andrew Lam <<a href="mailto:werdna.mal222@gmail.com">werdna.mal222@gmail.com</a>><br>
>>> >> wrote:<br>
>>> >>><br>
>>> >>> Ok Andy I can see it now thanks,<br>
>>> >>><br>
>>> >>> my variables are set to<br>
>>> >>><br>
>>> >>>  Module_vtkParallelMPI4Py        *OFF<br>
>>> >>>  PYTHON_EXECUTABLE               */bin/python2<br>
>>> >>>  PYTHON_EXTRA_LIBS               *<br>
>>> >>>  PYTHON_INCLUDE_DIR              */usr/include/python2.7<br>
>>> >>>  PYTHON_LIBRARY                  *//lib64/<a href="http://libpython2.7.so" rel="noreferrer" target="_blank">libpython2.7.so</a><br>
>>> >>>  PYTHON_UTIL_LIBRARY             */usr/lib64/libutil.so<br>
>>> >>>  VTK_ENABLE_VTKPYTHON            *ON<br>
>>> >>><br>
>>> >>> after I set VTK_WRAP_PYTHON CMake variable to ON<br>
>>> >>><br>
>>> >>> it seems ok to me, but let me know if they're wrong.<br>
>>> >>><br>
>>> >>> Thanks,<br>
>>> >>> Andrew<br>
>>> >>><br>
>>> >>> On Tue, Apr 11, 2017 at 3:30 PM, Andrew Lam <<a href="mailto:werdna.mal222@gmail.com">werdna.mal222@gmail.com</a>><br>
>>> >>> wrote:<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> Hi, my name is Andrew. I'm currently in a class that requires us to<br>
>>> >>>> install VTK.<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> I have an issue running make in my VTK-build directory. I get a<br>
>>> >>>> bunch of<br>
>>> >>>> clock skew issues that pop up that won't go away after calling<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> $ touch *<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> then it will print out<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> make[2]: *** [Wrapping/Python/<wbr>vtkAngularPeriodicDataArrayPyt<wbr>hon.cxx]<br>
>>> >>>> Error 1<br>
>>> >>>> make[1]: ***<br>
>>> >>>> [Wrapping/Python/CMakeFiles/<wbr>vtkCommonCorePythonD.dir/all]<br>
>>> >>>> Error 2<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> it will then run to about 32% and then end printing<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> make: *** [all] Error 2<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> I'm using python 2.7, VTK 7.1.1, cmake 3.7.2<br>
>>> >>>> I'm also going to include the output of the make call. Please let me<br>
>>> >>>> know if you have any suggestions or if you need any more information<br>
>>> >>>> to<br>
>>> >>>> understand the issue.<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> [  0%] Built target kwiml_test<br>
>>> >>>> [  0%] Built target vtksys<br>
>>> >>>> [  1%] Built target vtkWrappingTools<br>
>>> >>>> [  1%] Built target vtkalglib<br>
>>> >>>> [  1%] Built target vtkexpat<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkzlib<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkDICOMParser<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkEncodeString<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkjpeg<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkHashSource<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkglew<br>
>>> >>>> [  2%] Built target H5make_libsettings<br>
>>> >>>> [  2%] Built target H5detect<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkWrapTcl<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkParseJava<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkWrapPython<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkWrapPythonInit<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkWrapTclInit<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkWrapJava<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkjsoncpp<br>
>>> >>>> [  2%] Built target verdict<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtksqlite<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkoggtheora<br>
>>> >>>> [  2%] Built target vtkWrapHierarchy<br>
>>> >>>> [  4%] Built target vtkproj4<br>
>>> >>>> [  4%] Built target vtkfreetype<br>
>>> >>>> [  5%] Built target vtklibxml2<br>
>>> >>>> [  5%] Built target vtkpng<br>
>>> >>>> [  5%] Built target vtkmetaio<br>
>>> >>>> [  5%] Built target vtkgl2ps<br>
>>> >>>> [  5%] Built target vtktiff<br>
>>> >>>> [ 20%] Built target vtkCommonCore<br>
>>> >>>> [ 26%] Built target VTKData<br>
>>> >>>> [ 28%] Built target vtkCommonSystem<br>
>>> >>>> [ 29%] Built target vtkCommonMath<br>
>>> >>>> [ 29%] Built target vtkhdf5<br>
>>> >>>> [ 29%] Built target vtkWrappingPythonCore<br>
>>> >>>> [ 29%] Built target vtkLocalExample<br>
>>> >>>> [ 29%] Built target vtkCommonMisc<br>
>>> >>>> [ 29%] Built target vtkCommonTransforms<br>
>>> >>>> [ 29%] Built target vtkCommonSystemCxxTests<br>
>>> >>>> [ 29%] Python Wrapping - generating vtkAbstractArrayPython.cxx<br>
>>> >>>> [ 29%] Built target vtkhdf5_hl<br>
>>> >>>> Usage: vtkWrapPython-7.1 [options] infile...<br>
>>> >>>>   --help            print this help message<br>
>>> >>>>   --version         print the VTK version<br>
>>> >>>>   -o <file>         the output file<br>
>>> >>>>   -I <dir>          add an include directory<br>
>>> >>>>   -D <macro[=def]>  define a preprocessor macro<br>
>>> >>>>   -U <macro>        undefine a preprocessor macro<br>
>>> >>>>   @<file>           read arguments from a file<br>
>>> >>>>   --hints <file>    the hints file to use<br>
>>> >>>>   --types <file>    the type hierarchy file to use<br>
>>> >>>>   --concrete        force concrete class (ignored, deprecated)<br>
>>> >>>>   --abstract        force abstract class (ignored, deprecated)<br>
>>> >>>>   --vtkobject       vtkObjectBase-derived class (ignored,<br>
>>> >>>> deprecated)<br>
>>> >>>>   --special         non-vtkObjectBase class (ignored, deprecated)<br>
>>> >>>> make[2]: *** [Wrapping/Python/<wbr>vtkAbstractArrayPython.cxx] Error 1<br>
>>> >>>> make[2]: *** Waiting for unfinished jobs....<br>
>>> >>>> [ 29%] Built target vtkpython<br>
>>> >>>> [ 29%] Python Wrapping - generating<br>
>>> >>>> vtkAngularPeriodicDataArrayPyt<wbr>hon.cxx<br>
>>> >>>> Usage: vtkWrapPython-7.1 [options] infile...<br>
>>> >>>>   --help            print this help message<br>
>>> >>>>   --version         print the VTK version<br>
>>> >>>>   -o <file>         the output file<br>
>>> >>>>   -I <dir>          add an include directory<br>
>>> >>>>   -D <macro[=def]>  define a preprocessor macro<br>
>>> >>>>   -U <macro>        undefine a preprocessor macro<br>
>>> >>>>   @<file>           read arguments from a file<br>
>>> >>>>   --hints <file>    the hints file to use<br>
>>> >>>>   --types <file>    the type hierarchy file to use<br>
>>> >>>>   --concrete        force concrete class (ignored, deprecated)<br>
>>> >>>>   --abstract        force abstract class (ignored, deprecated)<br>
>>> >>>>   --vtkobject       vtkObjectBase-derived class (ignored,<br>
>>> >>>> deprecated)<br>
>>> >>>>   --special         non-vtkObjectBase class (ignored, deprecated)<br>
>>> >>>> make[2]: *** [Wrapping/Python/<wbr>vtkAngularPeriodicDataArrayPyt<wbr>hon.cxx]<br>
>>> >>>> Error 1<br>
>>> >>>> make[1]: ***<br>
>>> >>>> [Wrapping/Python/CMakeFiles/<wbr>vtkCommonCorePythonD.dir/all]<br>
>>> >>>> Error 2<br>
>>> >>>> make[1]: *** Waiting for unfinished jobs....<br>
>>> >>>> Scanning dependencies of target vtkCommonMathCxxTests<br>
>>> >>>> make[2]: Warning: File<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> `Common/Math/Testing/Cxx/<wbr>CMakeFiles/<wbr>vtkCommonMathCxxTests.dir/<wbr>depend.make'<br>
>>> >>>> has modification time 0.041 s in the future<br>
>>> >>>> [ 29%] Building CXX object<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> Common/Math/Testing/Cxx/<wbr>CMakeFiles/<wbr>vtkCommonMathCxxTests.dir/<wbr>vtkCommonMathCxxTests.cxx.o<br>
>>> >>>> [ 29%] Building CXX object<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> Common/Math/Testing/Cxx/<wbr>CMakeFiles/<wbr>vtkCommonMathCxxTests.dir/<wbr>TestAmoebaMinimizer.cxx.o<br>
>>> >>>> [ 30%] Built target vtkCommonCoreCxxTests<br>
>>> >>>> [ 30%] Building CXX object<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> Common/Math/Testing/Cxx/<wbr>CMakeFiles/<wbr>vtkCommonMathCxxTests.dir/<wbr>TestMatrix3x3.cxx.o<br>
>>> >>>> [ 30%] Building CXX object<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> Common/Math/Testing/Cxx/<wbr>CMakeFiles/<wbr>vtkCommonMathCxxTests.dir/<wbr>TestPolynomialSolversUnivariat<wbr>e.cxx.o<br>
>>> >>>> [ 30%] Building CXX object<br>
>>> >>>><br>
>>> >>>> Common/Math/Testing/Cxx/<wbr>CMakeFiles/<wbr>vtkCommonMathCxxTests.dir/<wbr>TestQuaternion.cxx.o<br>
>>> >>>> [ 30%] Linking CXX executable ../../../../bin/<wbr>vtkCommonMathCxxTests<br>
>>> >>>> [ 32%] Built target vtkCommonDataModel<br>
>>> >>>> make[2]: warning:  Clock skew detected.  Your build may be<br>
>>> >>>> incomplete.<br>
>>> >>>> [ 32%] Built target vtkCommonMathCxxTests<br>
>>> >>>> make: *** [all] Error 2<br>
>>> >>>><br>
>>> >>><br>
>>> >>><br>
>>> >>> ______________________________<wbr>_________________<br>
>>> >>> Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
>>> >>><br>
>>> >>> Visit other Kitware open-source projects at<br>
>>> >>> <a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/<wbr>opensource/opensource.html</a><br>
>>> >>><br>
>>> >>> Please keep messages on-topic and check the VTK FAQ at:<br>
>>> >>> <a href="http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.vtk.org/Wiki/VTK_<wbr>FAQ</a><br>
>>> >>><br>
>>> >>> Search the list archives at: <a href="http://markmail.org/search/?q=vtkusers" rel="noreferrer" target="_blank">http://markmail.org/search/?q=<wbr>vtkusers</a><br>
>>> >>><br>
>>> >>> Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
>>> >>> <a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/vtkusers" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/<wbr>mailman/listinfo/vtkusers</a><br>
>>> >>><br>
>>> >><br>
>>> ><br>
>>> ><br>
>>> > ______________________________<wbr>_________________<br>
>>> > Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
>>> ><br>
>>> > Visit other Kitware open-source projects at<br>
>>> > <a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/<wbr>opensource/opensource.html</a><br>
>>> ><br>
>>> > Please keep messages on-topic and check the VTK FAQ at:<br>
>>> > <a href="http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.vtk.org/Wiki/VTK_<wbr>FAQ</a><br>
>>> ><br>
>>> > Search the list archives at: <a href="http://markmail.org/search/?q=vtkusers" rel="noreferrer" target="_blank">http://markmail.org/search/?q=<wbr>vtkusers</a><br>
>>> ><br>
>>> > Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
>>> > <a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/vtkusers" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/<wbr>mailman/listinfo/vtkusers</a><br>
>>> ><br>
>>><br>
>>><br>
>>><br>
>>> --<br>
>>> Cory Quammen<br>
>>> Staff R&D Engineer<br>
>>> Kitware, Inc.<br>
>><br>
>><br>
><br>
><br>
> ______________________________<wbr>_________________<br>
> Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
><br>
> Visit other Kitware open-source projects at<br>
> <a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/<wbr>opensource/opensource.html</a><br>
><br>
> Please keep messages on-topic and check the VTK FAQ at:<br>
> <a href="http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.vtk.org/Wiki/VTK_<wbr>FAQ</a><br>
><br>
> Search the list archives at: <a href="http://markmail.org/search/?q=vtkusers" rel="noreferrer" target="_blank">http://markmail.org/search/?q=<wbr>vtkusers</a><br>
><br>
> Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
> <a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/vtkusers" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/<wbr>mailman/listinfo/vtkusers</a><br>
><br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
Cory Quammen<br>
Staff R&D Engineer<br>
Kitware, Inc.<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>