<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">2016-08-11 11:18 GMT+02:00 Elvis Stansvik <span dir="ltr"><<a href="mailto:elvis.stansvik@orexplore.com" target="_blank">elvis.stansvik@orexplore.com</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div>Hi all,<br><br></div>I'm wrestling with a volume rendering problem.<br><br></div>I've set up a very basic pipeline that just renders a volume.<br><br></div><div>As source it uses a custom reader I wrote that loads a volume from a HDF5 dataset (float).<br><br>It seemed to be working fine with the volume I had been testing with (see attached works_fine.png), which was a 120x120x2000. In addition to the the rendering itself, the screenshot shows a histogram plot I was using for debugging, as well as some editor controls I use to modify the color/opacity transfer function.<br><br></div><div>I then tested with another volume which is larger (300x300x5000), but apart from that has pretty much the same characteristic for its scalar values as the first one, and all of a sudden I don't see anything. See the attached not_working.png, which shows the setup using the problematic volume.<br><br></div><div>As you can in the histogram, there's a lot of voxel values roughly around 1, much like in the first volume, so I would expect that with the same transfer functions (black color, and an opacity ramp from 0.0,0.0 up to 5.0,1.0), I should see _something_.<br><br></div><div>I'm pretty sure I'm missing something basic here, but does anyone have an idea why I get the expected rendering with my smaller volume, but not with the bigger one?<br><br></div><div>Thanks a lot for any advice!<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br></font></span></div></div></blockquote><div><br></div><div>Sorry, shortly after sending this I think I got one step closer to an explanation. The file from which I load this second, larger, volume is actually a concatenation of several files, and I just tried loading one of the files separately and it worked fine (the rendering looks as expected). So something is probably wrong in the script I use for concatenating HDF5 files. I'll do some digging there.<br><br></div><div>Elvis<br></div><div> <br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br></font></span></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div>Elvis<br></div></font></span><div><br></div><div>PS. If you're confused by the range of the vtkAxisActor that you see in the screenshots, when comparing to the the volume sizes I stated above, it's because my custom render currently hardcodes the spacing to 0.2. DS.<br></div></div>
</blockquote></div><br></div></div>