<div dir="ltr">Hi Roman,<div><br></div><div>Do the attached images match the artifacts that you see?  The output</div><div>of vtkPolyDataToImageStencil is binary (each voxel is "on" or "off"), so</div><div>it is impossible for it, on its own, to produce different shades of grey.</div><div><br></div><div>What filters are you using downstream of vtkPolyDataToImageStencil?</div><div><br></div><div> - David</div><div><br></div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jan 5, 2015 at 7:33 AM, Dr. Roman Grothausmann <span dir="ltr"><<a href="mailto:grothausmann.roman@mh-hannover.de" target="_blank">grothausmann.roman@mh-hannover.de</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi David,<span class=""><br>
<br>
On 05/01/15 15:20, David Gobbi wrote:<br>
> The .mha file that you attached is giving me an error:<br>
><br>
>    MetaImage: M_ReadElementsData: data not read completely<br>
>       ideal = 1316134911 : actual = 87431<br>
<br></span>
Sorry, it was compressed with my MHA plugin for fiji which does not recompute CompressedDataSize because ITK happily ignores any mismatches except for reporting;-)<br>
Attached the file compressed with ITK itself (possible because the data is less than 4GB, see <a href="https://issues.itk.org/jira/browse/ITK-3321" target="_blank">https://issues.itk.org/jira/<u></u>browse/ITK-3321</a>).<br>
<br>
Just noticed: it also contains artifacts in slices 130 to 142.<br>
<br>
Many thanks for looking into this.<br>
Roman<br>
<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span class="">
On Mon, Jan 5, 2015 at 5:55 AM, Dr. Roman Grothausmann<br></span>
<<a href="mailto:grothausmann.roman@mh-hannover.de" target="_blank">grothausmann.roman@mh-<u></u>hannover.de</a> <mailto:<a href="mailto:grothausmann.roman@mh-hannover.de" target="_blank">grothausmann.roman@mh-<u></u>hannover.de</a>>><span class=""><br>
wrote:<br>
<br>
    Hi David,<br>
<br>
<br>
    Many thanks for improving vtkPolyDataToImageStencil. I tested the git branch<br>
    on 141229 in conjunction with my Voxelizer plug-in for Blender<br></span>
    (<a href="http://www.midasjournal.org/__browse/publication/882" target="_blank">http://www.midasjournal.org/_<u></u>_browse/publication/882</a><br>
    <<a href="http://www.midasjournal.org/browse/publication/882" target="_blank">http://www.midasjournal.org/<u></u>browse/publication/882</a>>) and I still get some<span class=""><br>
    artifacts in the result (see first two slices of attached MHA) with e.g. an<br>
    icosahedron (scale set to 100) as found in the attachment. Is that related<br>
    to the bugs of vtkPolyDataToImageStencil?<br>
<br>
    Kind regards,<br>
    Roman<br></span></blockquote></blockquote></div></div></div></div>