<div dir="ltr">Hi Vincent,<div><br></div><div>Use an opacity transfer function that makes the black voxels transparent.</div><div><br></div><div>You can unwrap the tube by reslicing it through an inverse cylindrical transformation (e.g. vtkCylindricalTransform and vtkImageReslice).</div><div><br></div><div> - David</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Nov 6, 2014 at 7:05 AM, Vincent32160 <span dir="ltr"><<a href="mailto:vsh@magellium.fr" target="_blank">vsh@magellium.fr</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Thanks again David!<br>
<br>
As I want to keep a volume I chose solution 2.<br>
I used a volume mapper and the result is pretty good.<br>
The only problem is that I am not able to remove the black voxels around the<br>
cylinder. (See picture)<br>
<<a href="http://vtk.1045678.n5.nabble.com/file/n5729393/output2.png" target="_blank">http://vtk.1045678.n5.nabble.com/file/n5729393/output2.png</a>><br>
<br>
The next step of my approach is to be able to keep only the voxels on the<br>
edges (meaning on a tube or hollow cylinder of 1-voxel thickness). And after<br>
that I would like to unfold the tube and have a flat surface of pixels.<br>
Let me know if you think that it is better to create a new thread for these<br>
two next steps.<br>
<br>
Thanks for your help.<br>
<br>
Vincent<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
View this message in context: <a href="http://vtk.1045678.n5.nabble.com/Extract-a-tube-of-data-from-DICOM-series-data-tp5729381p5729393.html" target="_blank">http://vtk.1045678.n5.nabble.com/Extract-a-tube-of-data-from-DICOM-series-data-tp5729381p5729393.html</a><br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5">Sent from the VTK - Users mailing list archive at Nabble.com.<br>
_______________________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at <a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the VTK FAQ at: <a href="http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ" target="_blank">http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/vtkusers" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/vtkusers</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>