<div dir="ltr"><div class="gmail_quote"><div dir="ltr"><font color="#000000">Dear RTK experts,</font><div><font color="#000000"><br></font></div><div><font color="#000000">I am reconstructing Varian ProBeam projections of the Xim image format. I have written the reader myself - very similar to the Hnd one already available with RTK.<br>Links to my fork: [<a href="https://github.com/agravgaard/RTK/blob/master/code/rtkXimImageIO.cxx" target="_blank">XimReader</a>, <a href="https://github.com/agravgaard/RTK/blob/master/code/rtkVarianProBeamXMLFileReader.cxx" target="_blank">XMLReader</a>, <a href="https://github.com/agravgaard/RTK/blob/master/code/rtkVarianProBeamGeometryReader.cxx" target="_blank">GeometryReader</a>]</font></div><div><font color="#000000"><br></font></div><div><font color="#000000">The reader apparently works (Images and angles displays as expected in UI), however when reconstructing with a regular FDK<b> I get a reconstructed image that is smeared out around the high and low density areas </b>[see attached image] <br><br>I'm using half arc, full fan images with no bow-tie filter from Scripps (~520 projections). Fixed detector and source (offset=0) with SID=2m, SDD=3m.</font></div><div><font color="#000000"><br></font></div><div><font color="#000000"><b>For the Hnd projections the reconstruction works perfectly (<a href="https://github.com/agravgaard/cbctrecon/blob/master/cbctrecon.cpp#L2726" target="_blank">Same algorithm</a>).</b><br>The reconstruction of the Xim projections performed on Varian software works perfectly.<br><br>Without the Parker Short Scan Filter the first and last projections creates streaks across the reconstruction as if they were way too bright. </font></div><div><font color="#000000">If the first few projections are excluded, the following projection will act the same way.</font></div><div><font color="#000000"><br></font></div><div><font color="#000000">The projections are corrected for beam hardening and all the projections have the expected attenuation. <br>No "smearing" filters (like median) is used, and iterative reconstruction makes the same artifacts.<br><br>Setting the value of the first and last projection to zero has the same effect as excluding. Changing the ramp filter only changes noise, not the artifacts.</font></div><div><font color="#000000"><br></font></div><div><font color="#000000"><b>Have any of you had a similar problem? </b>Am I missing something?<br>Any suggestions are welcome I'm running out of ideas.</font></div><div><font color="#000000"><br></font></div><div><font color="#000000">Best regards <br>Andreas<br clear="all"></font><div><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><p style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="color:rgb(31,73,125)" lang="EN-US"><span style="font-size:11pt;line-height:115%;font-family:calibri,sans-serif" lang="EN-US">______________________________<wbr>____</span></span></p><p style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="color:rgb(31,73,125)" lang="EN-US"><span style="font-size:11pt;line-height:115%;font-family:calibri,sans-serif" lang="EN-US">Andreas Gravgaard Andersen</span></span></p><div><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"times new roman",serif;color:black"><span style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Department of Oncology, </span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"times new roman",serif;color:black"><span style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Aarhus University Hospital<u></u><u></u></span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"times new roman",serif;color:black"><span style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)" lang="DA">Nørrebrogade 44,</span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"times new roman",serif;color:black"><span style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)" lang="DA">8000, Aarhus C<u></u></span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"times new roman",serif;color:black"><span style="font-size:11pt;font-family:calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)" lang="DA">Mail:     <a href="mailto:andreasg@phys.au.dk" target="_blank">andreasg@phys.au.dk</a></span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"times new roman",serif;color:black"><span style="color:rgb(31,73,125);font-family:calibri,sans-serif;font-size:11pt">Cell:     </span><span style="color:rgb(31,73,125);font-family:calibri,sans-serif;font-size:11pt"> </span><a value="+4523382411" style="font-family:calibri,sans-serif;font-size:11pt;color:rgb(17,85,204)">+45 3165 8140</a></p></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>