<div dir="ltr"><div>Hi,</div><div><br></div><div>--lowmem and --subset work for reducing memory footprint for projection data, and --division for memory usage of reconstruction calculation.</div><div>SetProjectionSubsetSize() does not correspond to --division but to --subset flag.</div><div>If you read the code, you will find without --lowmen the reader is updated before other part of the pipeline being executed; whereas with --lowmen flag it is updated together with the pipeline, thus is streamed.</div><div><br></div><div>Regards,</div><div>Chao</div><div><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2016-04-21 14:55 GMT+02:00 AMJAD N <span dir="ltr"><<a href="mailto:amjad.n.cet@gmail.com" target="_blank">amjad.n.cet@gmail.com</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi Simon,<div><br></div><div>How can i use --lowmem as a code? BTW I am using SetProjectionSubsetSize(16) in my code. Is that what you meant by -- divisions 8? still it doesn't work for 500^3.</div><div><br></div><div>I also tried by using itk::StreamingImageFilter to write the reconstructed volume. My requirement is 1024^3 volume.</div><div><br></div><div>Thanks and Regards,</div><div><br></div><div>AMJAD N<br><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Apr 21, 2016 at 5:50 PM, Simon Rit <span dir="ltr"><<a href="mailto:simon.rit@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">simon.rit@creatis.insa-lyon.fr</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Try --lowmem and if it still doesn't work, --divisions 8 (the higher this number the less memory).<br></div>Simon<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote"><div><div>On Thu, Apr 21, 2016 at 1:44 PM, AMJAD N <span dir="ltr"><<a href="mailto:amjad.n.cet@gmail.com" target="_blank">amjad.n.cet@gmail.com</a>></span> wrote:<br></div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div><div><div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>I tried to run rtkfdk ( ROOSTER sample ) with following command.</div><div><br></div><div>-p . -r .*.his -o fdk.mha -g geometry.rtk --hann 0.5 --pad 1.0 --dimension 500 --spacing 2<br></div><div><br></div><div>to identify the impact of large reconstructed volume (500^3). Still it gives memory allocation error.</div><div>What might be the issue here?</div><div><br></div><div>Thanks and Regards</div><span><font color="#888888"><div><br></div><div>AMJAD N</div></font></span></div>
<br></div></div>_______________________________________________<br>
Rtk-users mailing list<br>
<a href="mailto:Rtk-users@public.kitware.com" target="_blank">Rtk-users@public.kitware.com</a><br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</blockquote></div><br></div></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Rtk-users mailing list<br>
<a href="mailto:Rtk-users@public.kitware.com">Rtk-users@public.kitware.com</a><br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div></div>