<div dir="ltr">Hi dear RTK users. Sorry, its offtop post... i just wanna tell you about my problems if anyone can help me..<br>I develop scanner. Reconstruction of parallelepiped or cube (<a href="http://i.imgur.com/9YHyfWH.jpg">http://i.imgur.com/9YHyfWH.jpg</a>) caused to phantom artifact (<a href="http://i.imgur.com/yyI184j.png">http://i.imgur.com/yyI184j.png</a>). Don't look at noise, its test scan, without averaging and big rotation step.  Yea, it seems that its mainly misalignments problems, so i calibrated sourceX, sourceY, detectorX, detectorY by the following method <br><a href="http://www1.jinr.ru/Pepan_letters/panl_2015_5/10_gongad.pdf">http://www1.jinr.ru/Pepan_letters/panl_2015_5/10_gongad.pdf</a>, got sourceX = -215 mkm, sourceY = 650 mkm, detectorX = 50mkm. i specify this information but without success.<br><br>I also wrote a little program in this way<br>    for (float sourceXOffset_ = sourceXFrom; sourceXOffset_ < sourceXTo; sourceXOffset_ += searchStep)<br>    for (float sourceYOffset_ = sourceYFrom; sourceYOffset_ < sourceYTo; sourceYOffset_ += searchStep)<br>    for (float projXOffset = projXFrom; projXOffset < projXTo; projXOffset += searchStep)<br>    {<br>        sprintf(cmd, "./rtksimulatedgeometry -o geometry.xml --n 90 --arc=360 --sdd=232.241 --sid=170 --source_x=%.6f --source_y=%.6f --proj_iso_x=%.6f", sourceXOffset_, sourceYOffset_, projXOffset);<br><br>        int r = system(cmd);<br><br>        sprintf(cmd, "./rtkfdk --hardware=cuda -p /home/fee/Public/ -r [0-9]+.tif$ -o dump/out.mha -g geometry.xml --verbose --dimension 800,1,800 --spacing 0.0296 --newspacing 0.0148 --neworigin -18.137,-12.128,0 --subsetsize=1 -l --origin -11.8252,-3.55,-11.8252");<br>        r = system(cmd);<br>...<br><br>to search scanner alignment but also without success.<br><br>I noticed interesting thing: when i specially offset detector horizontally to the right by 4.5mm from the center, and specify it by --proj_iso_x=4.5 when generating geometry file, phantom disappears! (<a href="http://i.imgur.com/OOsPsfL.png">http://i.imgur.com/OOsPsfL.png</a>) I even take scans when the detector on the center, reconstruct it, and here is phantom artifact, then i manually offset picture to the left on the tifs (from <a href="http://i.imgur.com/FGxCJUo.png">http://i.imgur.com/FGxCJUo.png</a> to <a href="http://i.imgur.com/brbp5sd.png">http://i.imgur.com/brbp5sd.png</a>), and it reconstructs without phantom with --proj_iso_x=4.5! So, for this moment i work in this way, take scans when detector on the center, manually offset picture to the left and specify it by proj_iso_x to avoid phantom artifact, but its HUGE WORKAROUND =))<br><br><br>What do you think about it ? If its geometry issue, why real or virtual offset of detector cleans up the phantom artifact?<br><br></div>