<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=windows-1252"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    Hi, and welcome to RTK,<br>
    <br>
    Gengetopt is the piece of software that parses the command line
    arguments in all RTK applications. You do not have to "use" it. You
    just need to give correct arguments on the command line.<br>
    <br>
    The message "--output' ('-o') option required" means what it says :
    you need to provide the name of the file in which you want to store
    the geometry information generated by the application
    rtkelektasynergygeometry. If you just copy-pasted the command you
    found on the wiki, then something went wrong during the copy-paste.
    Try to run the following : <br>
    <br>
    rtkelektasynergygeometry --image_db IMAGE.DBF --frame_db FRAME.DBF
    --dicom_uid 1.3.46.423632.135428.1351013645.166 -o elektaGeometry<br>
    <br>
    I just removed the '\' and the useless spaces. You can do the same
    for all other command line examples and it should work.<br>
    <br>
    Let us know if you keep encountering trouble.<br>
    Cyril<br>
    <br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">Le 30/11/2015 12:06, niloufar teyfouri
      a écrit :<br>
    </div>
    <blockquote
cite="mid:CALChM12F4PuiLvgENg3Yyn7E+uZ7iPJ+GiY04z7VQ-90AS83EA@mail.gmail.com"
      type="cite">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=windows-1252">
      <div dir="ltr"><br clear="all">
        <div><span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">I ran the
            application of Electa Reconstruction implemented by you with</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">RTK. But
            after debugging I was encountered with the message of</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">"--output'
            ('-o') option required". Could you please help me for
            running</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">this example
            and the other ones?</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">I don't know
            any thing about the texts in the gray boxes mentioned at</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">each link
            related to examples of RTK.</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">For example
            in the link of</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <a moz-do-not-send="true"
href="http://wiki.openrtk.org/index.php/RTK/Examples/ElektaReconstruction"
            rel="noreferrer" target="_blank" style="font-size:12.8px">http://wiki.openrtk.org/index.php/RTK/Examples/ElektaReconstruction</a><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">how I should
            use gengetopt for the instructions below?</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <br style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <br style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">2. Run the
            application to convert Elekta's geometry into RTKs
            (DICOM_UID</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">is contained
            in the subfolder name of the his files):</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <br style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)"> 
            rtkelektasynergygeometry \</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">   
            --image_db IMAGE.DBF \</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">   
            --frame_db FRAME.DBF \</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">   
            --dicom_uid 1.3.46.423632.135428.135101364</span><span
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">5.166 \</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">    -o
            elektaGeometry</span><br
            style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <br style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">
          <span style="font-size:12.8px;color:rgb(80,0,80)">I would be
            appreciate if one could answer my question.</span><br>
        </div>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Rtk-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Rtk-users@public.kitware.com">Rtk-users@public.kitware.com</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  
<br /><br />
<hr style='border:none; color:#909090; background-color:#B0B0B0; height: 1px; width: 99%;' />
<table style='border-collapse:collapse;border:none;'>
        <tr>
                <td style='border:none;padding:0px 15px 0px 8px'>
                        <a href="https://www.avast.com/antivirus">
                                <img border=0 src="http://static.avast.com/emails/avast-mail-stamp.png" alt="Avast logo" />
                        </a>
                </td>
                <td>
                        <p style='color:#3d4d5a; font-family:"Calibri","Verdana","Arial","Helvetica"; font-size:12pt;'>
                                L'absence de virus dans ce courrier électronique a été vérifiée par le logiciel antivirus Avast.
                                <br><a href="https://www.avast.com/antivirus">www.avast.com</a>
                        </p>
                </td>
        </tr>
</table>
<br />
</body>
</html>