<div dir="ltr"><div><div><div><div>Hi Thibault,<br></div>SetProjectionsReaderFromGgo is a macro designed for the <a href="http://www.openrtk.org/Doxygen/classrtk_1_1ProjectionsReader.html">rtk::ProjectionsReader</a>, I'm not surprised that it does not work with the itk::ImageSeriesReader. It's not about the image type but about the filter type... We use this macro to set many parameters specific to the <a href="http://www.openrtk.org/Doxygen/classrtk_1_1ProjectionsReader.html">rtk::ProjectionsReader</a>. Since a while, I have made have a common <a href="https://github.com/SimonRit/RTK/blob/master/applications/rtkinputprojections_section.ggo">rtkinputprojections_section.ggo</a> file for all the applications that use the rtk::ProjectionsReader.<br></div>If you don't want to use the rtk::ProjectionsReader but itk::ImageSeriesReader (e.g., because it does a lot of automatic processing that you don't want), you'll have to write your own code to set it up.<br></div>I hope this clarifies things.<br></div>Simon<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Nov 2, 2015 at 2:08 PM, Notargiacomo Thibault <span dir="ltr"><<a href="mailto:gnthibault@gmail.com" target="_blank">gnthibault@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div><div>I recently experienced the following problem, when importing multiple tif files inside a directory using itk::ImageSeriesReader:<br><br>[...]<br>code/rtkGgoFunctions.h: In instantiation of ‘void rtk::SetProjectionsReaderFromGgo(typename TProjectionsReaderType::Pointer, const TArgsInfo&)<br>[...]<br>code/rtkGgoFunctions.h:121:61: error: no type named ‘OutputImageDirectionType’ in ‘class itk::ImageSeriesReader<itk::Image<short unsigned int, 3u> >’<br>   typename TProjectionsReaderType::OutputImageDirectionType direction;<br>[...]<br><br></div>It seems that, a new functionality added in rtkGgoFunctions.h (19/05/2015), allowing to directly modify input images properties through command line, like geometry (direction vector), assumes that the input image type defines OutputImageDirectionType, but in the case of itk::ImageSeriesReader, it does not.<br><br></div>Is this considered as a regression, or should the SetProjectionsReaderFromGgo function be used with specific input image type ?<br><br></div>Thank you in advance for your help.<br><br></div>Kind regards<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><br></font></span></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">Thibault Notargiacomo<br></font></span></div>
<br>_______________________________________________<br>
Rtk-users mailing list<br>
<a href="mailto:Rtk-users@public.kitware.com">Rtk-users@public.kitware.com</a><br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>