<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi Joel,<br>
    <br>
    I have fixed the wiki example (command line parameters AND data).
    Can you restart it from scratch and let me know if you still have
    problems ? <br>
    <br>
    Roughly, the problems were the following: <br>
    - the "mm_50.mha" motion mask file was not aligned with the CBCT
    coordinates<br>
    - the regularization parameters (gamma space and gamma time) were
    way too high. The regularization with a high gamma-time caused
    frames to be identical, while it should only discourage variations<br>
    <br>
    I hope it works, now. If it doesn't work for you, please keep asking<br>
    Cyril<br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 09/28/2015 09:52 AM, Cyril Mory
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote cite="mid:5608F1A0.9010903@uclouvain.be" type="cite">
      <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
        http-equiv="Content-Type">
      Hi Joel,<br>
      <br>
      I have just tried to reproduce the wiki example, and indeed, there
      are several mistakes in it. I am working on correcting them. I'll
      keep you posted.<br>
      <br>
      Cyril<br>
      <br>
      <br>
      <div class="moz-cite-prefix">On 09/26/2015 05:32 AM, Joel Beaudry
        wrote:<br>
      </div>
      <blockquote
cite="mid:CAMyfbWq5tprTBHHSz2zCGggpUaow4NsRZqZkhgbRtbd=AN7UbA@mail.gmail.com"
        type="cite">
        <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
          charset=ISO-8859-1">
        <div dir="ltr">
          <div>
            <div>
              <div>Hi RTK-users, <br>
                <br>
              </div>
              I'm unable to reproduce the images from the
              4DROOSTERReconstruction example. The 5 frames should show
              some differences pertaining to patient motion but the ones
              that I'm producing are identical, so no motion is visible.
              <br>
              <br>
              Has anyone been able to follow the example and the
              provided dataset to create a 4D image?<br>
              <br>
            </div>
            Thanks, <br>
          </div>
          Joel<br>
        </div>
        <br>
        <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
        <br>
        <pre wrap="">_______________________________________________
Rtk-users mailing list
<a moz-do-not-send="true" class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Rtk-users@public.kitware.com">Rtk-users@public.kitware.com</a>
<a moz-do-not-send="true" class="moz-txt-link-freetext" href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users</a>
</pre>
      </blockquote>
      <br>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>