<div dir="ltr">Hi Guangming,<div><br></div><div>If you half the spacing you need twice the dimension (in length, or 8 times in volume) to cover the same area, i.e. --spacing 1 --dimension 512.</div><div>Is this what you want?</div><div><br></div><div>Regards,</div><div>Chao</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2015-05-10 22:50 GMT+02:00 Guangming Zang <span dir="ltr"><<a href="mailto:guangming.zang@kaust.edu.sa" target="_blank">guangming.zang@kaust.edu.sa</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:'trebuchet ms',sans-serif"><font color="#0000ff">Hi all.</font></div><div class="gmail_default" style="font-family:'trebuchet ms',sans-serif"><font color="#0000ff">I have implemented SART algorithm with some optimizations.and i wanna to make a comparison with the implementations in our RTK.</font></div><div class="gmail_default" style="font-family:'trebuchet ms',sans-serif"><font color="#0000ff">My questions are:</font></div><div class="gmail_default" style="font-family:'trebuchet ms',sans-serif"><font color="#0000ff">1. how to use RTK to  generate the initial  volume(i.e., ground Truth )to make the comparison?</font></div><div class="gmail_default" style="font-family:'trebuchet ms',sans-serif"><font color="#0000ff">2. My answer to the question 1 is that maybe i can use <span style="font-family:monospace,monospace;font-size:14px;line-height:1.2em;background-color:rgb(249,249,249)">rtkdrawgeometricphantom to generate a reference volume. However, </span></font></div><div class="gmail_default" style="font-family:'trebuchet ms',sans-serif"><font color="#0000ff">I noticed that in  the <a href="http://wiki.openrtk.org/index.php/RTK/Examples/ADMMTVReconstruction" target="_blank">ADMMTV example in RTK wiki page,</a>  when i use the default demand, it works well (both for <span style="font-family:monospace,monospace;font-size:14px;line-height:1.2em;background-color:rgb(249,249,249)">rtkadmmtotalvariation and </span><span style="font-family:monospace,monospace;font-size:14px;line-height:16.7999992370605px;background-color:rgb(249,249,249)">rtkdrawgeometricphantom)</span><span style="font-family:monospace,monospace;font-size:14px;line-height:16.7999992370605px;background-color:rgb(249,249,249)"> </span><span style="font-family:monospace,monospace;font-size:14px;line-height:1.2em;background-color:rgb(249,249,249)"><br></span></font></div><div class="gmail_default" style="font-family:'trebuchet ms',sans-serif"><font color="#0000ff">. But when i change the spacing from 2 to 1, and dimension as 128. i.e. the commands</font><br></div><div class="gmail_default"><font color="#0000ff" face="trebuchet ms, sans-serif">from </font></div><div class="gmail_default"><font face="trebuchet ms, sans-serif"><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:14px;line-height:1.2em;background-color:rgb(249,249,249)">rtkdrawgeometricphantom </span><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:14px;line-height:1.2em">--spacing</span><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:14px;line-height:1.2em;background-color:rgb(249,249,249)"> </span><span style="font-size:14px;line-height:1.2em"><font color="#ff0000">2</font></span><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:14px;line-height:1.2em;background-color:rgb(249,249,249)"> </span><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:14px;line-height:1.2em">--dimension</span><span style="font-size:14px;line-height:1.2em;background-color:rgb(249,249,249)"><font color="#000000"> </font><font color="#ff0000">256</font></span><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:14px;line-height:1.2em">--phantomfile</span><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:14px;line-height:1.2em;background-color:rgb(249,249,249)"> SheppLogan.txt </span><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:14px;line-height:1.2em">-o</span><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:14px;line-height:1.2em;background-color:rgb(249,249,249)"> ref.mha</span></font></div><div class="gmail_default"><span style="font-size:14px;line-height:1.2em;background-color:rgb(249,249,249)"><font color="#0000ff" face="trebuchet ms, sans-serif">to </font></span></div><div class="gmail_default"><pre style="font-size:14px;padding:0px;border:0px none white;line-height:1.2em;font-stretch:normal;margin-top:0px;margin-bottom:0px;vertical-align:top;background-image:none;background-color:rgb(249,249,249);background-repeat:initial"><font face="trebuchet ms, sans-serif"><font color="#000000">rtkdrawgeometricphantom </font><span style="color:rgb(0,0,0)">--spacing</span><font color="#000000"> </font><span><font color="#ff0000">1</font></span><font color="#000000"> </font><span style="color:rgb(0,0,0)">--dimension</span><font color="#000000"> </font><font color="#ff0000">128 </font><span style="color:rgb(0,0,0)">--phantomfile</span><font color="#000000"> SheppLogan.txt </font><span style="color:rgb(0,0,0)">-o</span><font color="#000000"> ref.mha</font></font></pre><pre style="font-size:14px;padding:0px;border:0px none white;line-height:1.2em;font-stretch:normal;margin-top:0px;margin-bottom:0px;vertical-align:top;background-image:none;background-color:rgb(249,249,249);background-repeat:initial"><font face="trebuchet ms, sans-serif"><font color="#0000ff">the volume's visualization(</font><span style="color:rgb(0,0,0);line-height:1.2em">ref.mha</span><span style="color:rgb(0,0,255);line-height:1.2em">) is wired .</span></font></pre><pre style="font-size:14px;padding:0px;border:0px none white;line-height:1.2em;font-stretch:normal;margin-top:0px;margin-bottom:0px;vertical-align:top;background-image:none;background-color:rgb(249,249,249);background-repeat:initial"><font color="#0000ff" face="trebuchet ms, sans-serif">So can you help me to find what's going on or tell me a better way to make the comparison between RTK method and my implementations.</font></pre><pre style="font-family:monospace,monospace;font-size:14px;padding:0px;border:0px none white;color:rgb(0,0,0);line-height:1.2em;font-stretch:normal;margin-top:0px;margin-bottom:0px;vertical-align:top;background-image:none;background-color:rgb(249,249,249);background-repeat:initial"><br></pre><pre style="font-family:monospace,monospace;font-size:14px;padding:0px;border:0px none white;line-height:1.2em;font-stretch:normal;margin-top:0px;margin-bottom:0px;vertical-align:top;background-image:none;background-color:rgb(249,249,249);background-repeat:initial"><font color="#0000ff">Thanks in advance and with my best regards</font></pre><pre style="font-family:monospace,monospace;font-size:14px;padding:0px;border:0px none white;line-height:1.2em;font-stretch:normal;margin-top:0px;margin-bottom:0px;vertical-align:top;background-image:none;background-color:rgb(249,249,249);background-repeat:initial"><font color="#0000ff">Guangming</font></pre><pre style="font-family:monospace,monospace;color:rgb(0,0,0);font-size:14px;padding:0px;border:0px none white;line-height:1.2em;font-stretch:normal;margin-top:0px;margin-bottom:0px;vertical-align:top;background-image:none;background-color:rgb(249,249,249);background-repeat:initial"><br></pre></div><div><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><font style="line-height:23.3240013122559px" face="arial, helvetica, sans-serif" color="#674ea7"><b><i>Guangming Zang (Alex)</i></b></font><div style="line-height:23.3240013122559px"><font face="arial, helvetica, sans-serif"><b><i><font color="#0b5394">King Abdullah University of Science and Technology</font><font color="#073763">(KAUST)</font></i></b></font></div><div style="line-height:23.3240013122559px"><span style="font-family:arial;font-size:13px;line-height:20.0200004577637px"><font color="#0b5394"><b><i>University of Chinese Academy of Sciences(UCAS)</i></b></font></span><font face="arial, helvetica, sans-serif"><b><i><font color="#073763"><br></font></i></b></font></div><div style="line-height:23.3240013122559px"><span style="font-family:arial;font-size:13px;line-height:20.0200004577637px"><font color="#0b5394"><b><i><br></i></b></font></span></div><div style="line-height:23.3240013122559px"><span style="font-family:arial;font-size:13px;line-height:20.0200004577637px"><font color="#0b5394"><b><i><br></i></b></font></span></div><div style="line-height:23.3240013122559px"><br></div></div></div></div></div></div>
</div>

<br>
<div><hr></div><font face="Arial" size="1">This message and its contents, including attachments are intended solely for the original recipient. If you are not the intended recipient or have received this message in error, please notify me immediately and delete this message from your computer system. Any unauthorized use or distribution is prohibited. Please consider the environment before printing this email.</font><br>_______________________________________________<br>
Rtk-users mailing list<br>
<a href="mailto:Rtk-users@public.kitware.com">Rtk-users@public.kitware.com</a><br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>