<div dir="ltr"><div>Hi,</div><div> </div><div>I use rtkfdk to reconstruct varian cbct images following the example on rtk wiki page. The projections were obtained with half fan mode because it is an abdominal region with the patient lateral x AP dimension of 550x550. The reconstructed cbct images have a big bright circle around</div><div>the image. Please see the image:</div><div><a href="http://expirebox.com/download/2f55c9d8f0bc83138b954d2fec08e78c.html">http://expirebox.com/download/2f55c9d8f0bc83138b954d2fec08e78c.html</a></div><div> </div><div>I am using Ubuntu Linux box to reconstruct. Two sequential commands were used:</div><div> </div><div>./rtkvarianobigeometry --xml_file ProjectionInfo.xml --path Scan0/ --regexp Proj_.*.hnd -o varianGeometry<br></div><div>and </div><div> </div><div>rtkfdk \<br>   --geometry varianGeometry \<br>   --regexp .*.hnd \<br>   --path ../Scan0 \<br>   --output rec.mha \<br>   --verbose \<br>   --spacing 2.0,2.0,2.0 \<br>   --dimension 256,100,256 \<br></div><div>The projections are stored in the standard varian format: Scan0 and ProjectionInfo.xml with 644 projection images.  I assume that rtkfdk handled the half fan geometry properly. What did I do wrong then?  Many thanks!</div><div> </div><div>-howard</div></div>