<div dir="ltr"><div><div>Hi,<br></div>I wish there was a single industrial standard... You have the DICOM standard in mind and I used an IEC standard (see wiki). You can play with the --direction option to orientate the voxel axes of your image (see itk::Image documentation) and then reset the direction of your output image to identity, I think that will do what you want.<br></div>Simon<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Sep 10, 2014 at 1:35 PM, Chao Wu <span dir="ltr"><<a href="mailto:wuchao04@gmail.com" target="_blank">wuchao04@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>I see that rtk use certain industrial standard for the coordinates of 2D projections and 3D volumes. However in medical imaging, the xy planes of a volume are usually transaxial slices while the 3rd dimension is aligned with the axis of rotation. I would like to switch to this coordinates in my own code. Is there anyone who can give me some comments and suggestions about where to start? Thanks.</div><div><br></div><div>Regards,</div><div>Chao</div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Rtk-users mailing list<br>
<a href="mailto:Rtk-users@public.kitware.com">Rtk-users@public.kitware.com</a><br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/rtk-users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>