<html>
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<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hi Ken,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">So section 5.2 (<a href="http://cfconventions.org/Data/cf-conventions/cf-conventions-1.7/cf-conventions.html#_two_dimensional_latitude_longitude_coordinate_variables" class="">http://cfconventions.org/Data/cf-conventions/cf-conventions-1.7/cf-conventions.html#_two_dimensional_latitude_longitude_coordinate_variables</a>)
 doesn’t apply for arbitrary coordinate variables? I would have thought that it would be general and not just for latitude and longitude.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I have used the warp by scalar before, but I would prefer it if Paraview simply understood the geometry immediately. I have also found another method to adjust the grid which is quite good. The calculator has a Coordinate Results option which
 creates the vector field of the grid.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thanks,</div>
<div class="">David</div>
<div class=""><br class="">
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Dec 11, 2017, at 7:09 PM, Moreland, Kenneth <<a href="mailto:kmorel@sandia.gov" class="">kmorel@sandia.gov</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
David,<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
The way you are attempting to specify coordinates does not follow the CF convention. Your variables have a “coordinates” property that simply says “zc.” That is not sufficient in the CF convention to use that as a Z coordinate to add to the other independent
 coordinates. In fact, I cannot find any part of the CF convention (<a href="http://cfconventions.org/latest.html" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">http://cfconventions.org/latest.html</a>) that allows you to arbitrarily assign a
 Z coordinate to a 2D grid.<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
That said, accomplishing what you want is easy with ParaView. Just load your data like you are now (so it comes in as a flat rectilinear grid). Then run the “Warp By Scalar” filter and set the “Scalars” property to “zc”. That will apply the elevation to your
 data like you want.<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
-Ken<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div style="border-style: solid none none; border-top-width: 1pt; border-top-color: rgb(225, 225, 225); padding: 3pt 0in 0in;" class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class="">From:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>David Deepwell [<a href="mailto:ddeepwell@uwaterloo.ca" class="">mailto:ddeepwell@uwaterloo.ca</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Saturday, December 9, 2017 12:54 PM<br class="">
<b class="">To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Moreland, Kenneth <<a href="mailto:kmorel@sandia.gov" class="">kmorel@sandia.gov</a>><br class="">
<b class="">Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>David Deepwell <<a href="mailto:ddeepwell@uwaterloo.ca" class="">ddeepwell@uwaterloo.ca</a>>;
<a href="mailto:paraview@paraview.org" class="">paraview@paraview.org</a><br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>[EXTERNAL] Re: [Paraview] curvilinear CF conventions<o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hi Ken,<span class="Apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I’ve attached a file which I think satisfies the curvilinear CF conventions. The grid is 2 dimensional where the z coordinate (called zc) depends on the horizontal and vertical dimensions (x and z). <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Cheers,<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
David<o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<br class="">
<br class="">
<o:p class=""></o:p></div>
<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
On Dec 9, 2017, at 11:34 AM, Moreland, Kenneth <<a href="mailto:kmorel@sandia.gov" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">kmorel@sandia.gov</a>> wrote:<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
David,<span class="Apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
The netCDF/CF reader should be able to read curvilinear coordinates. There is not enough information in your email to determine whether the issue is with the ParaView reader or an issue with the data file. It would be helpful if you could send us an example
 file so we can replicate your problem.<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
-Ken<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Sent from my iPad<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 12pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
<br class="">
On Dec 9, 2017, at 9:12 AM, David Deepwell <<a href="mailto:ddeepwell@uwaterloo.ca" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">ddeepwell@uwaterloo.ca</a>> wrote:<o:p class=""></o:p></p>
</div>
<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="">
<div class="">
<div id="x_divtagdefaultwrapper" class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; color: rgb(33, 33, 33);" class="">Hi all,<br class="">
<br class="">
I have a netcdf file that follows the CF conventions in curvilinear (structured) coordinates. Paraview however doesn’t recognize the auxiliary variable as the grid variable on which the rest of the fields should be plotted on. I’m not sure if this a bug with
 paraview misinterpreting the CF convention or if I just happen to have an attribute missing that Paraview is looking for.<br class="">
<br class="">
Cheers,<br class="">
David</span><span style="font-size: 12pt;" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
</div>
</blockquote>
<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="">
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
_______________________________________________<br class="">
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<br class="">
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