<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 14 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
p
        {mso-style-priority:99;
        mso-margin-top-alt:auto;
        margin-right:0cm;
        mso-margin-bottom-alt:auto;
        margin-left:0cm;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
p.MsoAcetate, li.MsoAcetate, div.MsoAcetate
        {mso-style-priority:99;
        mso-style-link:"Balloon Text Char";
        margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:8.0pt;
        font-family:"Tahoma","sans-serif";}
span.EmailStyle18
        {mso-style-type:personal;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
span.EmailStyle19
        {mso-style-type:personal;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:#1F497D;}
span.EmailStyle20
        {mso-style-type:personal;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
span.EmailStyle21
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:#1F497D;}
span.BalloonTextChar
        {mso-style-name:"Balloon Text Char";
        mso-style-priority:99;
        mso-style-link:"Balloon Text";
        font-family:"Tahoma","sans-serif";}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-size:10.0pt;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body bgcolor="white" lang="EN-GB" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">Hi Chris,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">Yes, the way you call it is what I am using (if that was a question). Likewise, for parallel runs I start pvserver with<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">mpiexec -np 4 valgrind_callgrind pvserver and get 4 log files, one for each mpi execution. I have not tried pvbatch, but the logic should be similar.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">Regards,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">Axel<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> Christopher Neal [mailto:chrisneal@snumerics.com]
<br>
<b>Sent:</b> Tuesday, August 02, 2016 7:23 PM<br>
<b>To:</b> Gerstenberger, Axel; paraview@paraview.org<br>
<b>Subject:</b> Re: [Paraview] Profiling Paraview<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt">Thank you Axel!<br>
<br>
If I wanted to run the script through pvpython would I structure the command to be:<br>
<br>
valgrind_callgrind pvpython script.py  <br>
<br>
Thank you,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt">Chris Neal<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span lang="EN-US" style="color:black">From: </span></b><span lang="EN-US" style="color:black">ParaView <<a href="mailto:paraview-bounces@paraview.org">paraview-bounces@paraview.org</a>> on behalf of "Gerstenberger, Axel" <<a href="mailto:Axel.Gerstenberger@Rolls-Royce.com">Axel.Gerstenberger@Rolls-Royce.com</a>><br>
<b>Date: </b>Tuesday, August 2, 2016 at 2:58 AM<br>
<b>To: </b>"<a href="mailto:paraview@paraview.org">paraview@paraview.org</a>" <<a href="mailto:paraview@paraview.org">paraview@paraview.org</a>><br>
<b>Subject: </b>Re: [Paraview] Profiling Paraview<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-family:"Times New Roman","serif""><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">Hi Chris,</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">I am using valgrind & callgrind and visualize with kcachegrind and use the RelWithDebInfo for cmake as a compromise for speed of execution and useful output.</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">I have a bash script valgrind_callgrind in my PATH with:</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">#!/bin/bash </span>
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">valgrind -v --numcallers=50 --trace-children=yes --tool=callgrind --collect-jumps=yes --dump-instr=yes --dump-line=yes --collect-systime=yes “$@”</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">and call that like</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">valgrind_callgrind ./paraview  or valgrind_callgrind script.py.</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">You’ll get several callgrind.out.xxxxx for each process started. You can also profile Paraview python code and parallel runs, if you start pvserver with above command. kcachegrind is then used
 to look at each of these files.</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">Callgrind execution is quite slow, but it helped me a lot.</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">Cheers,</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D">Axel</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;color:#1F497D"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> ParaView [<a href="mailto:paraview-bounces@paraview.org">mailto:paraview-bounces@paraview.org</a>]
<b>On Behalf Of </b>Christopher Neal<br>
<b>Sent:</b> Monday, August 01, 2016 6:19 PM<br>
<b>To:</b> <a href="mailto:paraview@paraview.org">paraview@paraview.org</a><br>
<b>Subject:</b> [Paraview] Profiling Paraview</span><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt">Hello,</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt"> </span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt">For several months now I have had a serious issue with a Paraview Python script causing an enormous slowdown in the performance of Paraview as it executes. I have tried the old-fashioned method
 of peppering timing statements everywhere in the python script, but it is very tedious and hasn’t led me to the source of the issue. I was wondering if anyone has any suggestions for how to run a Paraview python script through a more advanced software profiler
 i.e. has anyone profiled the performance of Paraview as it executes a python script? And if so, what tools did you use?<br>
<br>
Thank you,</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt">Chris Neal</span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Times New Roman","serif"">Rolls-Royce Deutschland Ltd & Co KG Sitz/Registered Office: Blankenfelde-Mahlow, Deutschland, Registergericht/Court of Register: Amtsgericht Potsdam, HRA 2731 P, Persönlich haftende Gesellschafterin/General
 Partner: Rolls-Royce General Partner Limited, Sitz/Registered Office: Derby, United Kingdom, Register: Registry of Companies Wales and England, 4066556, Directors/Geschäftsführer: Paul O’Neil, Alastair McIntosh, Nicole Fehr, Dr. Holger Cartsburg Confidentiality
 Notice: This email and any attachments are confidential to the intended recipient and may also be privileged. If you are not the intended recipient please delete it from your system and notify the sender. You should not copy it or use it for any purpose nor
 disclose or distribute its contents to any other person. <o:p></o:p></span></p>
<p><br>
The data contained in, or attached to, this e-mail, may contain confidential information. If you have received it in error you should notify the sender immediately by reply e-mail, delete the message from your system and contact +44 (0) 3301235850 (Security
 Operations Centre) if you need assistance. Please do not copy it for any purpose, or disclose its contents to any other person.<o:p></o:p></p>
<p>An e-mail response to this address may be subject to interception or monitoring for operational reasons or for lawful business practices.<o:p></o:p></p>
<p>(c) 2016 Rolls-Royce plc<o:p></o:p></p>
<p>Registered office: 62 Buckingham Gate, London SW1E 6AT Company number: 1003142. Registered in England.<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-family:"Times New Roman","serif"">_______________________________________________ Powered by
<a href="http://www.kitware.com">www.kitware.com</a> Visit other Kitware open-source projects at
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a> Please keep messages on-topic and check the ParaView Wiki at:
<a href="http://paraview.org/Wiki/ParaView">http://paraview.org/Wiki/ParaView</a> Search the list archives at:
<a href="http://markmail.org/search/?q=ParaView">http://markmail.org/search/?q=ParaView</a> Follow this link to subscribe/unsubscribe:
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/paraview">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/paraview</a>
<o:p></o:p></span></p>
</div>
Rolls-Royce Deutschland Ltd & Co KG Sitz/Registered Office: Blankenfelde-Mahlow, Deutschland, Registergericht/Court of Register: Amtsgericht Potsdam, HRA 2731 P, Persönlich haftende Gesellschafterin/General Partner: Rolls-Royce General Partner Limited, Sitz/Registered
 Office: Derby, United Kingdom, Register: Registry of Companies Wales and England, 4066556, Directors/Geschäftsführer: Paul O’Neil, Alastair McIntosh, Nicole Fehr, Dr. Holger Cartsburg Confidentiality Notice: This email and any attachments are confidential
 to the intended recipient and may also be privileged. If you are not the intended recipient please delete it from your system and notify the sender. You should not copy it or use it for any purpose nor disclose or distribute its contents to any other person.
<P><br>The data contained in, or attached to, this e-mail, may contain confidential information. If you have received it in error you should notify the sender immediately by reply e-mail, delete the message from your system and contact +44 (0) 3301235850 (Security Operations Centre) if you need assistance. Please do not copy it for any purpose, or disclose its contents to any other person.</P>
<P>An e-mail response to this address may be subject to interception or monitoring for operational reasons or for lawful business practices.</P>
<P>(c) 2016 Rolls-Royce plc</P><span lang=EN-GB>
<P dir=ltr align=left>Registered office: 62 Buckingham Gate, London SW1E 6AT Company number: 1003142. Registered in England.</span></P></body>
</html>