<div dir="ltr"><br><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
distribution of ParaView. By the way, the NetCDF library used in the<br>
ParaView reader could only support NetCDF classic as default and you might<br>
need to install from source using NetCDF4 library.<br>
<br></blockquote><div><br></div><div>ParaView has supported netcdf4 since 3.14. 3.14.0 only through our internal libnetcdf/hdf; 3.14.1 added it through external too.</div><div><br></div><div>However, I do not know if anyone has used the pnetcdf variant. You may be the first Amir.</div><div><br></div><div>Can anyone else on the list comment on the status of pnetcdf support in ParaView?</div><div><br></div><div> <br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
I hope it helps,<br>
Regards,<br>
<br>
--ufuk<br>
<span class=""><br>
> A small pnetcdf file is attached.<br>
><br>
> The output of ncmpidump is the following:<br>
</span>> netcdf data_in {// file format: CDF-5 (big variables)dimensions:      x = 4 ; y<br>
<span class="">> = 4 ; z = 4 ;variables:       double data(x, y, z) ;<br>
> // global attributes:         :CDF-5 mode = 1 ;data:<br>
>  data =  -1.83667601732677e-48, -1.49975978266186e-32, 0,<br>
> 1.49975978266186e-32,  -1.49975978266186e-32, -1.22464679914735e-16, 0,<br>
> 1.22464679914735e-16,  0, 0, -0, -0,  1.49975978266186e-32,<br>
> 1.22464679914735e-16, -0, -1.22464679914735e-16,  -1.49975978266186e-32,<br>
> -1.22464679914735e-16, 0, 1.22464679914735e-16,  -1.22464679914735e-16,<br>
> -1, 0, 1,  0, 0, -0, -0,  1.22464679914735e-16, 1, -0, -1,  0, 0, -0, -0,<br>
>  0, 0, -0, -0,  -0, -0, 0, 0,  -0, -0, 0, 0,  1.49975978266186e-32,<br>
> 1.22464679914735e-16, -0, -1.22464679914735e-16,  1.22464679914735e-16,<br>
> 1, -0, -1,  -0, -0, 0, 0,  -1.22464679914735e-16, -1, 0, 1 ;}<br>
><br>
><br>
</span><span class="">> From: <a href="mailto:amiramir12345@outlook.com">amiramir12345@outlook.com</a><br>
> To: <a href="mailto:paraview@paraview.org">paraview@paraview.org</a><br>
> Subject: PNetCDF 64 bit Error<br>
> Date: Sun, 5 Jul 2015 16:33:49 -0500<br>
><br>
><br>
><br>
><br>
> I am getting an error when loading a NetCDF file that is written using<br>
> CDF-5 mode using pnetcdf library. This is the error output:<br>
><br>
><br>
> ERROR: In<br>
> /home1/01249/gda/modules/paraview/ParaView-v4.3.1-source/VTK/Common/ExecutionModel/vtkExecutive.cxx,<br>
</span>> line 784vtkPVCompositeDataPipeline (0x2aaab6364390): Algorithm<br>
<span class="">> vtkVisItMFIXCDFReader(0x2aaab635b0e0) returned failure for request:<br>
> vtkInformation (0x2aaab6263000)  Debug: Off  Modified Time: 885475<br>
> Reference Count: 1  Registered Events: (none)  Request:<br>
> REQUEST_DATA_OBJECT  ALGORITHM_AFTER_FORWARD: 1  FORWARD_DIRECTION: 0<br>
><br>
><br>
> When I run ncmpidump on the data file it shows the following:<br>
</span>> netcdf data_in {// file format: CDF-5 (big variables)dimensions:      x =<br>
<span class="">> 1024; y = 1024 ;      z = 1024 ;variables:    double data(x, y, z) ;<br>
> // global attributes:         :CDF-5 mode = 1 ;}<br>
><br>
> There is no problem if I create the file using the classical mode for a<br>
</span>> smaller dimension (<2^32), and I can load it into paraview.However, for<br>
<span class="">> large problems I have to enable CDF-5.<br>
><br>
> I am using paraview 4.3.1.<br>
><br>
</span>>                                                                                 _______________________________________________<br>
> Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
><br>
> Visit other Kitware open-source projects at<br>
> <a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
><br>
> Please keep messages on-topic and check the ParaView Wiki at:<br>
> <a href="http://paraview.org/Wiki/ParaView" rel="noreferrer" target="_blank">http://paraview.org/Wiki/ParaView</a><br>
><br>
> Search the list archives at: <a href="http://markmail.org/search/?q=ParaView" rel="noreferrer" target="_blank">http://markmail.org/search/?q=ParaView</a><br>
><br>
> Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
> <a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/paraview" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/paraview</a><br>
><br>
<br>
_______________________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at <a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ParaView Wiki at: <a href="http://paraview.org/Wiki/ParaView" rel="noreferrer" target="_blank">http://paraview.org/Wiki/ParaView</a><br>
<br>
Search the list archives at: <a href="http://markmail.org/search/?q=ParaView" rel="noreferrer" target="_blank">http://markmail.org/search/?q=ParaView</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/paraview" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/paraview</a><br>
</blockquote></div><br></div></div>