<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Hi John
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thanks a lot for your kind response. There are two parts to my question:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">1. <u class="">Creating H5Part Files:</u> Which version of H5Part should I use for creating “parallel-hdf5 based H5Part” files - <span style="font-family: 'Times New Roman', serif; font-size: 12pt;" class="">H5Hut 1.99.13 or </span><span style="font-family: 'Times New Roman', serif; font-size: 12pt;" class="">H5Part
 1.6.6 ? Is this code on git somewhere ?</span></div>
<div class=""><font face="Times New Roman, serif" size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font face="Times New Roman, serif" size="3" class="">2. <u class="">
Reading H5Part Files in PV</u>: As I understand from your email, I shall try pv-4.4 branch after I have created them.</font></div>
<div class=""><font face="Times New Roman, serif" size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font face="Times New Roman, serif" size="3" class="">Looking forward for your kind advice on point 1 mentioned above.</font></div>
<div class=""><font face="Times New Roman, serif" size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font face="Times New Roman, serif" size="3" class="">Regards</font></div>
<div class=""><font face="Times New Roman, serif" size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font face="Times New Roman, serif" size="3" class="">amit</font></div>
<div class=""><font face="Times New Roman, serif" size="3" class=""><br class="">
</font>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1;">
<div class="">
<div class="" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">
<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div class="" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;">
<br class="">
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Sep 9, 2015, at 2:07 AM, Biddiscombe, John A. <<a href="mailto:biddisco@cscs.ch" class="">biddisco@cscs.ch</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">Amit<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">the version of the reader that I maintain is kept here<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><a href="https://github.com/biddisco/pv-meshless" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">https://github.com/biddisco/pv-meshless</a><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">It has a number of extensions and options that you will want to ignore.<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">You will see that the pv-4.4 branch was was tested against the paraview master branch a few months ago. if it doesn’t compile against or work with the latest
 master, please let me know as I only work on viz/paraview stuff part of my time, so I don’t get to maintain/update this as much as I’d like.<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">Note:<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">For parallel partitioning of particle data, you will want the pv-zoltan plugin<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""><a href="https://github.com/biddisco/pv-zoltan" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">https://github.com/biddisco/pv-zoltan</a><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class="">JB<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<span style="font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; color: rgb(31, 73, 125);" class=""> </span></div>
<div class="">
<div style="border-style: solid none none; border-top-color: rgb(181, 196, 223); border-top-width: 1pt; padding: 3pt 0cm 0cm;" class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<b class=""><span lang="EN-US" style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;" class="">From:</span></b><span lang="EN-US" style="font-size: 10pt; font-family: Tahoma, sans-serif;" class=""><span class="Apple-converted-space"> </span>Amit Goel [<a href="mailto:Amit.Goel@ucf.edu" class="">mailto:Amit.Goel@ucf.edu</a>]<span class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>08 September 2015 23:37<br class="">
<b class="">To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Berk Geveci<br class="">
<b class="">Cc:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Biddiscombe, John A.;
<a href="mailto:paraview-developers@paraview.org" class="">paraview-developers@paraview.org</a><br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Re: [Paraview-developers] H5Part and H5Hut<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
</div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
Dear Berk<span class="Apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
Thanks a lot for your response. <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
I was able to open H5part files, albeit with warnings in H5Part. Further, there seems to be multiple versions of H5Part floating around:<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
H5Hut 1.99.13<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
H5Part 1.6.6<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
Although the user manuals on H5Part and H5hut website describe the same structure for H5Part files, but seems like codes did go through a major restructuring. I also looked at code of Paraview H5PartReader plugin but was not able to find which version of H5Part
 code was embedded in reader. Further the H5Part code files itself have been made part of reader, thus plugin doesnt rely on separately present H5Part libraries.<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
I dont mind digging in and updating the H5Part Plugin and submit patches, but only if I knew where to find the latest stable version of H5Part itself. :-)<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
Having said that, I am now trying Gadget HDF5 format as my ultimate goal is to save my particle simulations in some HDF5 format and then render through Paraview.<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
Are there any other particle formats based on HDF5 that Paraview supports ?<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
Regards<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
Amit<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="">
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
On Sep 8, 2015, at 3:36 PM, Berk Geveci <<a href="mailto:berk.geveci@kitware.com" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">berk.geveci@kitware.com</a>> wrote:<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
Hi Amit,<span class="Apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
I CC'ed John who is the original author of that plugin. Hopefully, he can answer your question.<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
Maybe there is an updated version of the reader that handles a newer format. We would be<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
happy to update the plugin if there is a new version of the reader.<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
It does not look like H5hut is available so I can't speak to it. We are not currently doing any<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
work on the H5Part reader. As far as I know, we haven't received any user requests asking us<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
to update or fix it so far. <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
Best,<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
-berk<o:p class=""></o:p></div>
</div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
On Fri, Sep 4, 2015 at 4:09 PM, Amit Goel <<a href="mailto:Amit.Goel@ucf.edu" target="_blank" style="color: purple; text-decoration: underline;" class="">Amit.Goel@ucf.edu</a>> wrote:<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: 'Times New Roman', serif;" class="">
Hi<br class="">
<br class="">
I am new to this list. Please let me know if anyone knows the status of H5Part plugin ? My specific questions are:<br class="">
<br class="">
1. How to use it exactly. I tried opening a Cavity sample file from pvmeshless site. But it returns errors and warnings.<br class="">
<br class="">
2. What is status of H5hut and H5Part plugins in forthcoming versions of Paraview ?<br class="">
<br class="">
Regards<br class="">
<br class="">
— amit<br class="">
<br class="">
_______________________________________________<br class="">
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