<div dir="ltr">Hello Hong,<br><br>Thank you for reaching out about your issue. We'll investigate more on what the NIRFAST-Slicer capabilities are related to 2D Images and we will keep you posted.<div><br></div><div>I answered to you and attached NIRFAST mailing list, where users and developers can communicate. You can subscribe to it at <a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/nirfast">public.kitware.com/mailman/listinfo/nirfast</a>.</div><div><br></div><div>If anybody else on this mailing list has encountered similar problems and has feedbacks/solutions, your inputs are welcome!</div><div><br></div><div>Best regards,<br><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><span style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px">Alexis Girault</span><br style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><span style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px">R&D Engineer in Medical Computing</span><br style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><span style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px">Kitware, Inc.</span><br style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><br style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><a href="http://www.kitware.com/" rel="noreferrer" style="color:rgb(17,85,204);font-size:12.8px" target="_blank">http://www.kitware.com</a><br style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font color="#999999"><a href="tel:(919)+969-6990+x325" target="_blank"><span style="font-size:12.8px">(919) 969-6990 x3</span>25</a></font><br></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Fri, Sep 23, 2016 at 5:47 AM, Hong Yang <span dir="ltr"><<a href="mailto:cindyyanghong@gmail.com" target="_blank">cindyyanghong@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:-apple-system,blinkmacsystemfont,"segoe ui",roboto,helvetica,arial,sans-serif,"apple color emoji","segoe ui emoji","segoe ui symbol";font-size:14px;line-height:21px">Dear Mr. Girault,</span></div><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:-apple-system,blinkmacsystemfont,"segoe ui",roboto,helvetica,arial,sans-serif,"apple color emoji","segoe ui emoji","segoe ui symbol";font-size:14px;line-height:21px"><br></span></div><div class="gmail_default"><span style="font-family:-apple-system,blinkmacsystemfont,"segoe ui",roboto,helvetica,arial,sans-serif,"apple color emoji","segoe ui emoji","segoe ui symbol";color:rgb(51,51,51);font-size:14px;line-height:21px">I am Hong Yang, a phd student from Technical university of Munich. </span></div><div class="gmail_default"><span style="font-family:-apple-system,blinkmacsystemfont,"segoe ui",roboto,helvetica,arial,sans-serif,"apple color emoji","segoe ui emoji","segoe ui symbol";color:rgb(51,51,51);font-size:14px;line-height:21px"><br></span></div><div class="gmail_default"><span style="font-family:-apple-system,blinkmacsystemfont,"segoe ui",roboto,helvetica,arial,sans-serif,"apple color emoji","segoe ui emoji","segoe ui symbol";color:rgb(51,51,51);font-size:14px;line-height:21px">I want to use the </span><font color="#333333" face="-apple-system, blinkmacsystemfont, segoe ui, roboto, helvetica, arial, sans-serif, apple color emoji, segoe ui emoji, segoe ui symbol"><span style="font-size:14px;line-height:21px">NIRFAST slicer to<b> simulate the light fluence model </b>within my sample. However the software did not work. </span></font></div><div class="gmail_default"><i><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:-apple-system,blinkmacsystemfont,"segoe ui",roboto,helvetica,arial,sans-serif,"apple color emoji","segoe ui emoji","segoe ui symbol";font-size:14px;line-height:21px"><b>In my case, I only have one 2D image and the original data is saved with Matlab matrix. What I did is saving this matrix to an 'tif' image and load this tif image to the slicer.</b></span><font color="#333333" face="-apple-system, blinkmacsystemfont, segoe ui, roboto, helvetica, arial, sans-serif, apple color emoji, segoe ui emoji, segoe ui symbol"><span style="font-size:14px;line-height:21px"><br></span></font></i></div><div class="gmail_default"><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:-apple-system,blinkmacsystemfont,"segoe ui",roboto,helvetica,arial,sans-serif,"apple color emoji","segoe ui emoji","segoe ui symbol";font-size:14px;line-height:21px"><b><br></b></span></div><div class="gmail_default"><font color="#333333" face="-apple-system, blinkmacsystemfont, segoe ui, roboto, helvetica, arial, sans-serif, apple color emoji, segoe ui emoji, segoe ui symbol"><span style="font-size:14px;line-height:21px"><b>The following are my questions:</b></span></font></div><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:-apple-system,blinkmacsystemfont,"segoe ui",roboto,helvetica,arial,sans-serif,"apple color emoji","segoe ui emoji","segoe ui symbol";font-size:14px;line-height:21px">Can NIRFAST slicer work for single 2D image case?</span></div><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:-apple-system,blinkmacsystemfont,"segoe ui",roboto,helvetica,arial,sans-serif,"apple color emoji","segoe ui emoji","segoe ui symbol";font-size:14px;line-height:21px">If yes,  I try to do image crop and segmentation with the slicer, it crashed down every time I tried to crop the image. And if I skip the crop step and go to do segmentation, the label does not work. How can I solve this?</span><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:-apple-system,blinkmacsystemfont,"segoe ui",roboto,helvetica,arial,sans-serif,"apple color emoji","segoe ui emoji","segoe ui symbol";font-size:14px;line-height:21px"><br></span></div><div class="gmail_default"><font color="#333333" face="-apple-system, blinkmacsystemfont, segoe ui, roboto, helvetica, arial, sans-serif, apple color emoji, segoe ui emoji, segoe ui symbol"><span style="font-size:14px;line-height:21px">Thank you for your help.</span></font></div><div class="gmail_default"><font color="#333333" face="-apple-system, blinkmacsystemfont, segoe ui, roboto, helvetica, arial, sans-serif, apple color emoji, segoe ui emoji, segoe ui symbol"><span style="font-size:14px;line-height:21px"><br></span></font></div><div class="gmail_default"><font color="#333333" face="-apple-system, blinkmacsystemfont, segoe ui, roboto, helvetica, arial, sans-serif, apple color emoji, segoe ui emoji, segoe ui symbol"><span style="font-size:14px;line-height:21px">Best</span></font></div><span><font color="#888888"><div class="gmail_default"><font color="#333333" face="-apple-system, blinkmacsystemfont, segoe ui, roboto, helvetica, arial, sans-serif, apple color emoji, segoe ui emoji, segoe ui symbol"><span style="font-size:14px;line-height:21px">Hong</span></font></div></font></span></div>
</blockquote></div><br></div></div></div>