<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
> <b class="">Volumetric Mesh support:</b>
<div class=""><b class=""><br class="">
</b></div>
<div class="">Alexis, great to see that plan!</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I wanted to make you aware of 2 groups/extensions that generate unstructured meshes, so perhaps you could coordinate with the corresponding developers:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">* <a href="https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Modules/BodyCentricCubicMesh" class="">https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Modules/BodyCentricCubicMesh</a></div>
<div class="">* <a href="https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Extensions/CleaverExtension" class="">https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Extensions/CleaverExtension</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I am not using unstructured meshes, and I have not tried either of the extensions above for a very long time, but I wanted to at least make sure you are aware of those!</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Nov 23, 2016, at 2:50 PM, Alexis Girault <<a href="mailto:alexis.girault@kitware.com" class="">alexis.girault@kitware.com</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">Hi everyone,<br class="">
<br class="">
I wanted to introduce you to two topics I would like to investigate and discuss during the next conference call and the na-mic week in Boston:<br class="">
<br class="">
<b class="">Volumetric Mesh support:</b></div>
<div class="">We collaborate on a project which uses finite element meshes to compute light propagation within soft tissues for optical imaging. Their mesh is computed using label map images, and they would like to visualize their output data overlayed above
 the structural images used for the segmentation without having to resample it within the original volume domain. JC directed me to the interesting work that is still in
<a href="https://www.slicer.org/wiki/Modules:IA_FEMesh-Documentation-3.6" class="">
Slicer 3.6</a>. The discussion on this topic could be related to the potential wrapping of VTK unstructured grid, to think about where it could fall within the current nodes hierarchy (link with models...), etc...</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><b class="">MatLab tighter integration:</b></div>
<div class="">Right now - based on my current understanding of the framework - MatLabBridge allows us to forward commands to a MatLab server and retrieve information, and offers methods to convert data to and from MatLab, but the workspace environment instanciated
 while processing the given commands is lost (no way to still access the MatLab variables created, to keep using MatLab from the latest state). We would like to investigate a solution that would allow us to keep the MatLab state alive, to visualize the MatLab
 workspace variables within Slicer (table node?), to directly enter MatLab commands within Slicer (using a custom ctkConsole, like the python console?)<br class="">
<br class="">
Looking forward to hearing your thoughts and possible interests in those topics.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Best regards,</div>
<br clear="all" class="">
<div class="">
<div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class=""><span style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8000001907349px" class="">Alexis Girault</span><br style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8000001907349px" class="">
<span style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8000001907349px" class="">R&D Engineer in Medical Computing</span><br style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8000001907349px" class="">
<span style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8000001907349px" class="">Kitware, Inc.</span><br style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8000001907349px" class="">
<br style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8000001907349px" class="">
<a href="http://www.kitware.com/" rel="noreferrer" style="color:rgb(17,85,204);font-size:12.8000001907349px" target="_blank" class="">http://www.kitware.com</a><br style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8000001907349px" class="">
<font color="#999999" class=""><a href="tel:(919)+969-6990+x325" target="_blank" class=""><span style="font-size:12.8000001907349px" class="">(919) 969-6990 x3</span>25</a></font><br class="">
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
_______________________________________________<br class="">
Na-mic-project-week mailing list<br class="">
<a href="mailto:Na-mic-project-week@public.kitware.com" class="">Na-mic-project-week@public.kitware.com</a><br class="">
http://public.kitware.com/mailman/listinfo/na-mic-project-week<br class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
<p></p>

<p>The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
http://www.partners.org/complianceline . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.</p></body>
</html>