<div dir="ltr">I apologize I did not realize you were using a PDE based registration. It is my understanding that for this approach the images need to match in physical space, since the filter operates in way that matches pixel by pixel. <div><br></div><div>There is a few options:</div><div>1. You could limit the output region such that they are both fully contained in both images. See:<br></div><div><a href="https://itk.org/ITKExamples/src/Core/Common/ApplyAFilterOnlyToASpecifiedRegionOfAnImage/Documentation.html">https://itk.org/ITKExamples/src/Core/Common/ApplyAFilterOnlyToASpecifiedRegionOfAnImage/Documentation.html</a><br></div><div><br></div><div>2. You could pad the smaller image.</div><div><br></div><div>3. You could perform an affine registration first and resample the image.</div><div><br></div><div>-Sam</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Aug 3, 2017 at 12:57 PM, CocoM <span dir="ltr"><<a href="mailto:cgo_2113@hotmail.com" target="_blank">cgo_2113@hotmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">No I don't think so, it happens after triggering the registration process<br>
(before any iteration) but just once in the beginning and once in the end.<br>
But actually the deformation field is never updated because the physical<br>
spaces don't match so theoretically it's endless. The exception occurs both<br>
times in the function VerifyInputInformation, called by<br>
UpdateOutputInformation (ProcessObject).<br>
<br>
I am not using any optimizer because it's a registration method solving a<br>
PDE iteratively : itkLevelSetMotionRegistrationF<wbr>ilter. It works with a<br>
finite difference resolution scheme, but I can modify the time step,<br>
although I wouldn't really see the point. Any idea?<br>
<br>
Thanks,<br>
Marie<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
View this message in context: <a href="http://itk-insight-users.2283740.n2.nabble.com/3D-registration-with-level-set-motion-tp7590137p7590145.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://itk-insight-users.<wbr>2283740.n2.nabble.com/3D-<wbr>registration-with-level-set-<wbr>motion-tp7590137p7590145.html</a><br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5">Sent from the ITK Insight Users mailing list archive at Nabble.com.<br>
______________________________<wbr>_______<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/<wbr>opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/<wbr>products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_<wbr>FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/insight-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/<wbr>mailman/listinfo/insight-users</a><br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px;color:rgb(136,136,136)">Samuel Gerber</span><br style="font-size:12.8px;color:rgb(136,136,136)"><span style="font-size:12.8px;color:rgb(136,136,136)">R&D Engineer</span><br style="font-size:12.8px;color:rgb(136,136,136)"><span style="font-size:12.8px;color:rgb(136,136,136)">Kitware, Inc.</span><br></div></div>
</div>