<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<style type="text/css" style="display:none"><!-- p { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; }--></style>
</head>
<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>​Hi all,<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>I have a set of DICOM MR images which is scanned in Coronal, not Transverse. As a result, when I reconstructed them to a 3D volume using ITK, its orientation seems to be not the same as the that of the Transverse scanned 3D volume, whose orientation is standard
 LPS. My questions are<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>(1) Should I reorientation the Coronal scanned 3D volume to standard LPS orientation?<br>
</p>
<p>(2) If need, should I use itk.OrientImageFilter to do that? Or use any other methods?<br>
</p>
<p>(3) If need use itk.OrientImageFilter, how to write "orienter->SetDesiredCoordinateOrientation(itk::SpatialOrientation::ITK_COORDINATE_ORIENTATION_LPS)" using Python?<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Thanks in advance.<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Regards,<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Zhuangming Shen<br>
</p>
<p>​<br>
</p>
</body>
</html>