
<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">

    <p>Hi,</p>

    <p>I'd like to extract a sagittal slice from a 3d image volume. The

      application should be quite flexible and thus be able to process

      axial, coronal and sagittal image volumes. <br>

    </p>

    <p>This is my mini pipeline: OrientImageFilter ->

      ExtractImageFilter<br>

    </p>

    <p>The problem is that I keep getting the slice rotated 90° and

      flipped. ITK snap renderes the volume correctly with correct

      orientation labels. I've attached the source code and the input

      data volume. Of course I could rotate and flip the slice back, but

      that's not very elegant...</p>

    <p>Any hints what is going wrong here?</p>

    <p>Regards,</p>

    <p>Christina Roßmanith<br>

    </p>

    <p><img src="cid:part1.5EDA5980.29E4620A@neuro.ma.uni-heidelberg.de"

        alt=""></p>

    <p><img src="cid:part2.97AA846A.207E8AA5@neuro.ma.uni-heidelberg.de"

        alt=""></p>

  </body>

</html>