<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Hi Constance,</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">the lesion sizing toolkit builds with master version of ITK with examples and tests turned off. I will now try building with those on to see if some problems appear. I used VS2013 x64.</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Regards,</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Dženan</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Oct 13, 2016 at 10:48 AM, Owens,Constance A <span dir="ltr"><<a href="mailto:CAOwens@mdanderson.org" target="_blank">CAOwens@mdanderson.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">





<div lang="EN-US" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="m_5168399935580068930WordSection1">
<p class="MsoNormal">I was hoping to speak with someone who may be able to help me with installing and building Lesion Sizing Toolkit. Originally I tried to build LSTK with ITK v4.2.0 and VTK v7.0.0 but during the build process (I’m using Visual Studio 9 2008
 64x), 6 projects fail with the following errors:<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      1              fatal error C1083: Cannot open include file: '<wbr>itkLesionSegmentationImageFilt<wbr>er8.h': No such file or directory                c:\itk2\src\modules\remote\<wbr>lesionsizingtoolkit\examples\<wbr>itkLesionSegmentationCommandLi<wbr>neProgressReporter.h          <wbr>     
 22<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      2              fatal error C1083: Cannot open include file: 'itkImageFileReader.h': No such file or directory                c:\ITK2\src\Modules\Remote\<wbr>LesionSizingToolkit\Examples\<wbr>LesionSegmentation.cxx   1<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      3              fatal error C1083: Cannot open include file: 'itkVector.h': No such file or directory                c:\itk2\src\modules\remote\<wbr>lesionsizingtoolkit\utilities\<wbr>visualization\<wbr>vtkContourVisualizationModule.<wbr>h               
 22<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      4              fatal error C1083: Cannot open include file: 'vtkPolyDataWriter.h': No such file or directory                c:\ITK2\src\Modules\Remote\<wbr>LesionSizingToolkit\Utilities\<wbr>Visualization\<wbr>LesionSurfaceExtraction.cxx   <wbr> 
 21<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      5              fatal error C1083: Cannot open include file: 'vtkPolyDataWriter.h': No such file or directory                c:\ITK2\src\Modules\Remote\<wbr>LesionSizingToolkit\Utilities\<wbr>Visualization\<wbr>IsoSurfaceVolumeEstimation.<wbr>cxx               
 21<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      6              fatal error C1083: Cannot open include file: 'itkVector.h': No such file or directory                c:\itk2\src\modules\remote\<wbr>lesionsizingtoolkit\utilities\<wbr>visualization\<wbr>vtkContourVisualizationModule.<wbr>h               
 22<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      7              fatal error C1083: Cannot open include file: 'itkCommand.h': No such file or directory                c:\ITK2\src\Modules\Remote\<wbr>LesionSizingToolkit\Utilities\<wbr>Visualization\<wbr>ViewImageAndSegmentationSurfac<wbr>e.cxx               
 18<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      8              error C2039: 'MetaEvent' : is not a member of '`global namespace''                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaEvent.h             35<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      9              error C2499: 'itk::MetaEvent' : a class cannot be its own base class                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaEvent.h             35<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      10           error C2146: syntax error : missing ';' before identifier 'MetaObjectType'              <wbr>  c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  55<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      11           error C4430: missing type specifier - int assumed. Note: C++ does not support default-int                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  55<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      12           error C4430: missing type specifier - int assumed. Note: C++ does not support default-int                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  55<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      13           error C4430: missing type specifier - int assumed. Note: C++ does not support default-int                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  64<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      14           error C2143: syntax error : missing ',' before '*'                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  64<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      15           error C2143: syntax error : missing ';' before '*'                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  67<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      16           error C2433: 'itk::MetaConverterBase<<wbr>VDimension>::MetaObjectType' : 'virtual' not permitted on data declarations             c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  67<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      17           error C4430: missing type specifier - int assumed. Note: C++ does not support default-int                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  67<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      18           error C4430: missing type specifier - int assumed. Note: C++ does not support default-int                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  67<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      20           error C2143: syntax error : missing ';' before '*'                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  77<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      21           error C2433: 'itk::MetaConverterBase<<wbr>VDimension>::MetaObjectType' : 'virtual' not permitted on data declarations             c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  77<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      22           error C4430: missing type specifier - int assumed. Note: C++ does not support default-int                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  77<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      23           error C4430: missing type specifier - int assumed. Note: C++ does not support default-int                c:\itk2\src\modules\core\<wbr>spatialobjects\include\<wbr>itkMetaConverterBase.h        <wbr>  77<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      25           error C2143: syntax error : missing ';' before '*'                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   100<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      26           error C4430: missing type specifier - int assumed. Note: C++ does not support default-int                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   100<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      27           error C4430: missing type specifier - int assumed. Note: C++ does not support default-int                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   102<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      29           error C2061: syntax error : identifier 'MetaScene'                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   104<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      30           error C2065: 'MetaObject' : undeclared identifier                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   112<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      31           error C2059: syntax error : '>'                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   112<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      32           error C2143: syntax error : missing ';' before '{'                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   116<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      33           error C2653: 'TConverter' : is not a class or namespace name                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   117<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      34           error C2653: 'TConverter' : is not a class or namespace name                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   117<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      35           error C2143: syntax error : missing ';' before '}'                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   121<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      36           error C2143: syntax error : missing ';' before '{'                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   124<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      37           error C2653: 'TConverter' : is not a class or namespace name                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   125<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      38           error C2653: 'TConverter' : is not a class or namespace name                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   125<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      39           error C2143: syntax error : missing ';' before '}'                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   127<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      40           error C2065: 'transform' : undeclared identifier                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   128<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      41           error C2143: syntax error : missing ',' before ')'                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   128<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      42           error C2065: 'MetaObject' : undeclared identifier                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   130<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      43           error C2065: 'obj' : undeclared identifier                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   130<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      44           error C2143: syntax error : missing ',' before ')'                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   130<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      45           error C2143: syntax error : missing ';' before '}'                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   141<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Error      46           fatal error C1004: unexpected end-of-file found                C:\ITK2\src\Modules\Core\<wbr>SpatialObjects\include\<wbr>itkMetaSceneConverter.h   141<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Additionally, I am using CMake v3.6.1.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">I also tried to build it with VTK v5.10 and ITK v4.2 as suggested by the ITK Bar Camp document provided by this link:<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><a href="http://insightsoftwareconsortium.github.io/ITKBarCamp-doc/ITK/LungNoduleSegmentationWithLSTK.html" target="_blank">http://<wbr>insightsoftwareconsortium.<wbr>github.io/ITKBarCamp-doc/ITK/<wbr>LungNoduleSegmentationWithLSTK<wbr>.html</a><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">However, cmake showed an error requesting a version of VTK 6.0.0 or newer. I will try this version in the meantime, but was hoping to get some help on building LSTK.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:black">Thanks,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Arial",sans-serif;color:black">Constance Owens</span><span style="color:black"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Arial",sans-serif;color:black">Graduate Research Assistant<br>
<br>
</span><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Arial",sans-serif;color:#404040">The University of Texas Graduate School of Biomedical Sciences at Houston</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Arial",sans-serif;color:#404040"><br>
Medical Physics</span><span style="color:black"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Arial",sans-serif;color:#404040"><a href="https://mailbox.mdanderson.org/owa/redir.aspx?REF=1_J6y-0UTLZALKHOYAqJgthiuCumt3SSyTDe5aCeIfM-m0qTq4TTCAFtYWlsdG86Q0FPd2Vuc0BtZGFuZGVyc29uLm9yZw.." target="_blank"><span style="color:#954f72">CAOwens@mdanderson.org</span></a><br>
tel 713-745-3679 | cel 281-770-5210</span><span style="color:black"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<p class="MsoNormal">The information contained in this e-mail message may be
privileged, confidential, and/or protected from disclosure. This e-mail message
may contain protected health information (PHI); dissemination of PHI should
comply with applicable federal and state laws. If you are not the intended recipient,
or an authorized representative of the intended recipient, any further review,
disclosure, use, dissemination, distribution, or copying of this message or any
attachment (or the information contained therein) is strictly prohibited. If
you think that you have received this e-mail message in error, please notify
the sender by return e-mail and delete all references to it and its contents
from your systems.<u></u><u></u></p></div>

<br>______________________________<wbr>_______<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/<wbr>opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/<wbr>products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_<wbr>FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/insight-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/<wbr>mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>