<div dir="ltr">Yes, you need one object marker (which you already have in your image) and another marker for the background. The simplest way to choose this, in your case, is to mark any point which is far from the object marker.</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 8, 2015 at 11:43 PM, András Osztroluczki <span dir="ltr"><<a href="mailto:ahnryka@gmail.com" target="_blank">ahnryka@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">I have a rough segmentation (marked with 1 value) and the background is 0. Should i change the background to sth else and it will work? Cos now the result of the watershedfrommarker is image with full of 1 values. <div><br></div><div>Thanks for your time!<div><div class="h5"><br><br>On Wednesday, July 8, 2015, Richard Beare <<a href="mailto:richard.beare@gmail.com" target="_blank">richard.beare@gmail.com</a>> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">The watershedfrommarker requires seed regions. The trick is that you need at least two - one for the thing you want to segment and one for everything else. The seeds are regions in the marker image. </div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jul 9, 2015 at 6:25 AM, András Osztroluczki <span dir="ltr"><<a>ahnryka@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello ITK users!<div><br></div><div>Is there any way to aid the watershed segmentation (watershed, morph watershed, morphwatershedfrommarker) with user defined seed region ?</div><div><br></div><div>Thanks and Regards,</div><div>Andras</div></div>
<br>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/insight-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</blockquote></div></div></div>
<br>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/insight-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Regards,<br>Girish</div></div>
</div>