<div>Steve,</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>You are right, I meant each slice and not each pixel.</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Bill<br><br></div>
<div class="gmail_quote">On Nov 28, 2007 6:08 PM, Steve M. Robbins &lt;<a href="mailto:steve@sumost.ca">steve@sumost.ca</a>&gt; wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div class="Ih2E3d">On Wed, Nov 28, 2007 at 08:55:15AM +0100, Mathieu Malaterre wrote:<br>&gt; On Nov 28, 2007 4:40 AM, Steve M. Robbins &lt;<a href="mailto:steve@sumost.ca">steve@sumost.ca</a>&gt; wrote:<br>&gt; &gt; On Mon, Nov 26, 2007 at 11:22:25PM +0100, Mathieu Malaterre wrote:
<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &nbsp;To go into further details, PET for instance has a dynamic<br>&gt; &gt; &gt; slope/intersept.<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; What do you mean by &quot;dynamic slope/intercept&quot;? &nbsp;That the rescale
<br>&gt; &gt; slope and intercept are specified per-image, even when the image<br>&gt; &gt; series forms a volume? &nbsp;That&#39;s not limited to PT; CT has the<br>&gt; &gt; same behaviour, doesn&#39;t it?<br>&gt;<br>&gt; Hum...
<br>&gt; I have never seen this happen with CT images (due to the nature of<br>&gt; Houndsfield Units this is not typical to go beyond 16 bits well at<br>&gt; least for human composition, in which case a single rescale<br>
&gt; slope/intercept should be enough).<br><br></div>True. &nbsp;I asked the question not because I have seen it in practice,<br>but to make sure I understood what you and Bill were talking about.<br>Somewhere in that conversation it was mentioned that PET scales each
<br>*pixel* individually, which made me wonder whether I understood DICOM<br>correctly. &nbsp;(I think the comment about scaling by pixel was an error<br>and scaling by slice was intended.)<br>
<div class="Ih2E3d"><br><br>&gt; Do you have by any chance a sample dataset, or do you recall the<br>&gt; private vendor doing this ?<br><br></div>I don&#39;t recall any CT series in which rescale slope and intercept<br>
change.<br><br>However, let me tell you about a series I did come across in the wild.<br>It was MR and it had different *Bits Stored* across the series: a few<br>images had 12 bits, the next few had 13, some more had 14. &nbsp;I have no
<br>idea why they needed to do this, but it did expose a bug in our code.<br>I can&#39;t recall for certain, but I don&#39;t think this was a volumetric<br>data set.<br><br>The moral of the story is only that a DICOM reader ought to be
<br>prepared for almost anything and verify assumptions (such as &quot;all<br>rescales and slopes are equal&quot;) on the actual input.<br><br>Regards,<br><font color="#888888">-Steve<br><br></font><br>-----BEGIN PGP SIGNATURE-----
<br>Version: GnuPG v1.4.6 (GNU/Linux)<br><br>iD8DBQFHTfTZ0i2bPSHbMcURAtuuAJ42jlUrBTcfOLGOv4lkmb/kmJAP+gCgriqX<br>pDDSZWO9O2luqlOUTlG26Qk=<br>=d07T<br>-----END PGP SIGNATURE-----<br><br>_______________________________________________
<br>Insight-users mailing list<br><a href="mailto:Insight-users@itk.org">Insight-users@itk.org</a><br><a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users
</a><br><br></blockquote></div><br>