Luis, <br>Thanks for your response.&nbsp; I&#39;ve implemented your suggestions with no change in the results.<br>I&#39;ve set CC and CXX to /usr/local/bin/gcc and /usr/local/bin/c++ respectively.&nbsp; I also set the ITK_SOURCE_DIR and ITK_BINARY_DIR variables for good measure although I&#39;ve built fine without these set before.&nbsp; From the cvs checkout, I deleted and recreated the binary files and performed a make as before.&nbsp; I diff-ed the results and found them to be exactly the same.&nbsp; I repeated the entire operation with CXX set to /usr/local/bin/g++ - no changes in output.
<br>From the error file, the problem seems to be coming from problems in the system header files.&nbsp; I&#39;ve not compiled on this machine before so I don&#39;t know if it&#39;s ever been configured properly.&nbsp; Thanks for your help and let me know if you have any other suggestions.
<br><br>Regards,<br>Matt<br><br><br><br><div><span class="gmail_quote">On 8/8/07, <b class="gmail_sendername">Luis Ibanez</b> &lt;<a href="mailto:luis.ibanez@kitware.com">luis.ibanez@kitware.com</a>&gt; wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<br>Hi Matt,<br><br>Thanks for letting us know.<br><br>Please destroy the binary directory where you are building ITK,<br>and follow the build instructions described in the ITK Software Guide<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <a href="http://www.itk.org/ItkSoftwareGuide.pdf">
http://www.itk.org/ItkSoftwareGuide.pdf</a><br><br>In particular, please make sure that you set the environment variables<br>CC and CXX to the C and C++ compilers respectively, *BEFORE* you run<br>ccmake.<br><br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Regards,
<br><br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Luis<br><br><br>----------------------<br>Matt Kelsey wrote:<br>&gt; Hi Luis,<br>&gt;<br>&gt; I&#39;m using the latest cvs checkout (earlier today) of ITK and the output<br>&gt; of the commands are:<br>
&gt;<br>&gt; /grad2/kelsey-41&gt; echo $CC<br>&gt; CC: Undefined variable<br>&gt; /grad2/kelsey-42&gt; echo $CXX<br>&gt; CXX: Undefined variable<br>&gt;<br>&gt; however I see that in the advanced cmake configuration that:
<br>&gt; CMAKE_CXX_COMPILER == /usr/local/bin/c++<br>&gt; and<br>&gt; CMAKE_C_COMPILER == /usr/local/bin/gcc<br>&gt;<br>&gt; Any thoughts?<br>&gt;<br>&gt; Thanks,<br>&gt; Matt<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt; On 8/8/07, *Luis Ibanez* &lt;
<a href="mailto:luis.ibanez@kitware.com">luis.ibanez@kitware.com</a><br>&gt; &lt;mailto:<a href="mailto:luis.ibanez@kitware.com">luis.ibanez@kitware.com</a>&gt;&gt; wrote:<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Hi Matt,<br>&gt;<br>&gt;
<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1) What version of ITK are you using ?<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2) What are the output of the following commands?<br>&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; echo $CC<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; echo $CXX<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; It looks like you are using the C compiler instead
<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; of the C++ compiler.<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Please let us know about the two questions above.<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Thanks<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Luis<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ----------------
<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Matt Kelsey wrote:<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Hello all,<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; I&#39;m having trouble building ITK on a new machine.&nbsp;&nbsp;Here are the<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; uname -a<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; specs.<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; SunOS arktos 
5.10 Generic_125100-10 sun4u sparc SUNW,Sun-Fire-V445<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Some other info:<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; make --version -&gt; GNU Make 3.80<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; /usr/local/bin/gcc --version -&gt; gcc (GCC) 3.3<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; /usr/local/bin/c++ --version -&gt; c++ (GCC) 
3.3<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; I&#39;ve configured the project with ccmake version 2.4-patch 6 and<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; turned<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Examples/Test/Shared Libs off, build type Release. No problems with<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; ccmake.
<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; I run into trouble during the make on: Utilities/MetaIO/CMakeFiles<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; /ITKMetaIO.dir/metaUtils.o<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; I&#39;ve included the stdout and stderr.&nbsp;&nbsp;Any suggestions would be
<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; appreciated.<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Thanks,<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Matt Kelsey<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; link to stderr<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; =========================================<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; 
<a href="http://www.engr.siu.edu/grad2/kelsey/debug/make.err.txt">http://www.engr.siu.edu/grad2/kelsey/debug/make.err.txt</a><br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; &lt;<a href="http://www.engr.siu.edu/grad2/kelsey/debug/make.err.txt">http://www.engr.siu.edu/grad2/kelsey/debug/make.err.txt
</a><br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &lt;<a href="http://www.engr.siu.edu/grad2/kelsey/debug/make.err.txt">http://www.engr.siu.edu/grad2/kelsey/debug/make.err.txt</a>&gt;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; link to stdout
<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; =========================================<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; <a href="http://www.engr.siu.edu/grad2/kelsey/debug/make.output.txt">http://www.engr.siu.edu/grad2/kelsey/debug/make.output.txt</a><br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &lt;
<a href="http://www.engr.siu.edu/grad2/kelsey/debug/make.output.txt">http://www.engr.siu.edu/grad2/kelsey/debug/make.output.txt</a>&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ------------------------------------------------------------------------
<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; _______________________________________________<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Insight-users mailing list<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; <a href="mailto:Insight-users@itk.org">Insight-users@itk.org</a> &lt;mailto:
<a href="mailto:Insight-users@itk.org">Insight-users@itk.org</a>&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; <a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>&gt;<br>&gt;<br></blockquote>
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