<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii">
<META content="MSHTML 6.00.6000.16414" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV dir=ltr align=left><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=287055614-19022007>Hi everyone, please help if you 
can!</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=287055614-19022007></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=287055614-19022007>I have a multi-voxel 
magnetic resonance spectroscopy file (CSI - chemical shift imaging) and a T1 
volume, many slices.&nbsp; I need to know where exactly is the CSI grid (8x8 1ml 
voxels) in respect to the T1 volume.</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=287055614-19022007></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=287055614-19022007>I'm using a Siemens 
Allegra Magnetom 3T.</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=287055614-19022007></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=287055614-19022007>The CSI dicom file 
has this information in the header:</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=287055614-19022007></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=287055614-19022007><FONT face=Arial><FONT 
size=2>sSpecPara.sVoI.sPosition.dSag&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

-14.6151885<BR>sSpecPara.sVoI.sPosition.dCor&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

67.89309338<BR>sSpecPara.sVoI.sPosition.dTra&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

-25.70038393<BR>sSpecPara.sVoI.sNormal.dSag&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 

-0.4226182617<BR>sSpecPara.sVoI.sNormal.dCor&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
= 0.906307787<SPAN class=763403815-23022007><FONT 
color=#0000ff>&nbsp;</FONT></SPAN></FONT></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=287055614-19022007><FONT face=Arial><FONT size=2><SPAN 
class=763403815-23022007><FONT color=#0000ff>(<FONT 
color=#000000>sSpecPara.sVoI.sNormal.dTra&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
= 0.00307856</FONT><SPAN class=763403815-23022007><FONT 
color=#0000ff>&nbsp;</FONT></SPAN></FONT><FONT 
color=#0000ff>)</FONT></SPAN></FONT></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=287055614-19022007><FONT face=Arial size=2>but I don't know how 
to interpret it. They must somehow describe how the CSI grid is 
oriented...&nbsp; if, for instance, the first 3 of these 5 header lines 
describes a position (maybe of the center of the grid), the question is: in 
respect to what? to the high definition T1 image on which the CSI slice was 
positioned, or to the center of the magnet?</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=287055614-19022007><FONT face=Arial 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=287055614-19022007><FONT face=Arial size=2>Well, if someone 
knows what these 5 numbers are<SPAN class=763403815-23022007><FONT 
color=#0000ff>&nbsp; (occasionaly there are 6)&nbsp;</FONT></SPAN>, I'll be very 
grateful,</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=287055614-19022007><FONT face=Arial size=2>Thanks very 
much,</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=287055614-19022007><FONT face=Arial size=2>Stefano 
Peca</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=287055614-19022007><FONT face=Arial 
size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<P align=left><FONT size=2>Dr. Stefano Peca - MARBILab - "Enrico Fermi" Center @ 
Fondazione Santa Lucia - V.Ardeatina 306 - Roma, Italy - Tel.: +39 06 5150 1524 
- Fax: +39 06 5150 1528 - </FONT><A 
href="mailto:stefano.peca@roma1.infn.it"><FONT 
size=2>stefano.peca@roma1.infn.it</FONT></A><FONT size=2></A>&nbsp;-</FONT></P>
<DIV>&nbsp;</DIV></BODY></HTML>