<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=gb2312">
<META content="MSHTML 6.00.2900.2912" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style">Hi,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style"></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style">The fixedImage and the movingImage have the 
same spacing, origin, and size. Both are 256 x 256 x 48. I use the grid with 
size 256 x 256 x 1 and&nbsp;start index (0,0,24)&nbsp;as the resample grid. I do 
as below,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style"></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style">typedef itk::Image&lt;short, 3&gt; 
ImageType;</FONT></DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style">typedef 
itk::ResampleImageFilter&lt;ImageType, ImageType&gt;&nbsp; 
ResampleFilterType;</FONT></DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style">ResampleFilterType::Pointer resampler = 
ResampleFilterType::New();</FONT></DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style"></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style">&nbsp;resampler-&gt;SetTransform( transform 
);<BR>//&nbsp;resampler-&gt;SetInterpolator(this-&gt;interpolator);<BR>&nbsp;resampler-&gt;SetInput(&nbsp;movingImage 
);<BR>&nbsp;size =&nbsp; 
fixedImage-&gt;GetLargestPossibleRegion().GetSize();<BR>&nbsp;size[2] = 
1;<BR>&nbsp;index[2] = 24;<BR>&nbsp;index[0] = index[1] = 
0;<BR>&nbsp;this-&gt;resampler-&gt;SetSize(size);<BR>&nbsp;this-&gt;resampler-&gt;SetOutputStartIndex(index);<BR>&nbsp;this-&gt;resampler-&gt;SetOutputOrigin(&nbsp; 
fixedImage-&gt;GetOrigin() );<BR>&nbsp;this-&gt;resampler-&gt;SetOutputSpacing( 
fixedImage-&gt;GetSpacing() 
);<BR>&nbsp;this-&gt;resampler-&gt;SetDefaultPixelValue( 100 
);<BR>&nbsp;this-&gt;resampler-&gt;Update();</FONT></DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style"></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style">I use a identity transform. However, when I 
show the resampled image, it roate 90 degree relative to the correct position. I 
am confused about it.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style"></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style">Regards,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style"></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style">Yixun Liu</DIV>
<DIV><BR></DIV></FONT>
<DIV><FONT face="Bookman Old Style"></FONT>&nbsp;</DIV></BODY></HTML>