<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.2900.2873" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY 
style="WORD-WRAP: break-word; khtml-nbsp-mode: space; khtml-line-break: after-white-space" 
bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hi Nick,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>if I see this the right way, the only way to 
achieve this kind of meshing would</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>be to use the ITK - Mesh and create a mesh - input 
file from this mesh,&nbsp;which the FEM - Filter </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>can read, right?</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>I didn't have a look at the itk mesh yet, but is it 
appropriate for tatrahedral mesh generation which</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>can be used to create a fem - mesh?</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Further question:</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>What is the concrete function of these lines (taken 
from software guide), why two different</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>membrane - types, which one is actually 
created?:</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;typedef 
itk::fem::Element3DC0LinearHexahedronMembrane&nbsp;&nbsp; 
Element3DType;<BR>&nbsp;typedef 
itk::fem::Element3DC0LinearTetrahedronMembrane&nbsp; 
Element3DType2;<BR></DIV></FONT>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp; {<BR>//&nbsp; Software Guide : 
BeginCodeSnippet<BR>&nbsp; Element3DType::LoadImplementationFunctionPointer fp = 
<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
&amp;itk::fem::ImageMetricLoadImplementation&lt;ImageLoadType&gt;::ImplementImageMetricLoad;<BR>&nbsp; 
DispatcherType::RegisterVisitor((ImageLoadType*)0,fp);<BR>//&nbsp; Software 
Guide : EndCodeSnippet&nbsp; <BR>&nbsp; }<BR>&nbsp; {<BR>&nbsp; 
Element3DType2::LoadImplementationFunctionPointer fp =<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
&amp;itk::fem::ImageMetricLoadImplementation&lt;ImageLoadType&gt;::ImplementImageMetricLoad;<BR>&nbsp; 
DispatcherType2::RegisterVisitor((ImageLoadType*)0,fp);<BR>&nbsp; }</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Regards,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Markus</FONT></DIV>
<BLOCKQUOTE 
style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #000000 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV style="FONT: 10pt arial">----- Original Message ----- </DIV>
  <DIV 
  style="BACKGROUND: #e4e4e4; FONT: 10pt arial; font-color: black"><B>From:</B> 
  <A title=ntustison@gmail.com href="mailto:ntustison@gmail.com">Nicholas 
  Tustison</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>To:</B> <A title=m.weigert@fz-juelich.de 
  href="mailto:m.weigert@fz-juelich.de">Markus Weigert</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Cc:</B> <A title=insight-users@itk.org 
  href="mailto:insight-users@itk.org">insight-users@itk.org</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Sent:</B> Monday, June 12, 2006 5:41 PM</DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Subject:</B> Re: [Insight-users] Adaptive 
  Meshing for FEM - Registration</DIV>
  <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT><FONT face=Arial size=2></FONT><FONT 
  face=Arial size=2></FONT><BR></DIV>
  <DIV>Hi Markus,</DIV>
  <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT><FONT face=Arial size=2></FONT><BR 
  class=khtml-block-placeholder></DIV>
  <DIV>A straightforward conversion between an ITK mesh and a FEM mesh is 
  non-existent.&nbsp; I'm reworking the FEM mesh class now and maybe I'll come 
  up with something but until then...</DIV>
  <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT><FONT face=Arial size=2></FONT><BR 
  class=khtml-block-placeholder></DIV>
  <DIV>The current FEM framework allows for an external mesh to be brought into 
  the FEM project but that, in addition to the default rectilinear mesh that is 
  created when no external mesh is specified, is the extent of the current FEM 
  library meshing capabilities. &nbsp;</DIV>
  <DIV><BR class=khtml-block-placeholder></DIV>
  <DIV>Nick Tustison</DIV>
  <DIV><BR class=khtml-block-placeholder></DIV><BR>
  <DIV>
  <DIV>On Jun 12, 2006, at 11:32 AM, Markus Weigert wrote:</DIV><BR 
  class=Apple-interchange-newline>
  <BLOCKQUOTE type="cite">
    <DIV><FONT face=Arial size=2>Hi all,</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2>in the insight book ("Insight into Images") 
    from Terry S. Yoo,</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2>there&nbsp;is a&nbsp;nice example of adaptive 
    lung meshing (page 331).</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2>My question is, how can such a meshing be 
    obtained with ITK </FONT><FONT face=Arial size=2>in&nbsp;3D?</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2>I suppose, one can use the ITK - Mesh framework 
    for this task,</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2>but the ITK Mesh would need to be casted to a 
    FEM - Mesh.</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2>Can this casting be done in a straight forward 
    way, or is it more complicated?</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2>Also, this would be interesting because one 
    could start to segment an image</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2>and mesh individual surfaces to model each 
    tissue with different elasticity.</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2>Any idears on this???</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2>Regards,</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2>Markus</FONT></DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
    <DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
    <DIV 
    style="MARGIN: 0px">_______________________________________________</DIV>
    <DIV style="MARGIN: 0px">Insight-users mailing list</DIV>
    <DIV style="MARGIN: 0px"><A 
    href="mailto:Insight-users@itk.org">Insight-users@itk.org</A></DIV>
    <DIV style="MARGIN: 0px"><A 
    href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</A></DIV></BLOCKQUOTE></DIV><BR></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>