<DIV>Hi all ! </DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>I am using itkOrientImagefilter&nbsp; to change the&nbsp;&nbsp; orientation of image volumes ; If I&nbsp; want to change from RSA to RAI is working ok , but from ASL to RAI&nbsp; doesn't&nbsp; ; actually instead of RAI , I obtain ILP ; I studied the code a little and I observed that in function DeterminePermutationsAndFlips(...) , when more than 1 permutation must be done , a cyclic permutation is applied ;&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;I tried to change &nbsp;the permute order (from left to right ): so instead&nbsp;&nbsp; <BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; m_PermuteOrder[i] = j; <BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; m_PermuteOrder[j] = k; <BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; m_PermuteOrder[k] = i;<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<BR>I put&nbsp;&nbsp; :</DIV>
<DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; m_PermuteOrder[i] = k;<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; m_PermuteOrder[j] = i;<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; m_PermuteOrder[k] = j;</DIV>
<DIV><BR>this way seems to work ok, but I don't&nbsp;think&nbsp; is correct ; </DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>maybe I don't use the filter properly ; this is my code :</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>c3OrientImageFilterType::Pointer m_c3OrientImageFilter = c3OrientImageFilterType::New();<BR>m_c3OrientImageFilter-&gt;SetInput(m_c3Reader-&gt;GetOutput());<BR>&nbsp;&nbsp;<BR>m_c3OrientImageFilter-&gt;SetGivenCoordinateOrientation((itk::SpatialOrientation::ITK_COORDINATE_ORIENTATION_ASL);<BR>m_c3OrientImageFilter-&gt;SetDesiredCoordinateOrientation(itk::SpatialOrientation::ITK_COORDINATE_ORIENTATION_RAI);<BR>&nbsp;<BR>m_c3Image = m_c3OrientImageFilter-&gt;GetOutput();<BR>m_c3Image-&gt;Update();</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>For visualisation (checking the orientations) I am using vtk&nbsp; (vtkImagePlaneWidget) ;</DIV>
<DIV>The version of itk is 2.0</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>Thank you very much for your help !</DIV>
<DIV><BR>Roxana</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV><p>__________________________________________________<br>Do You Yahoo!?<br>Tired of spam?  Yahoo! Mail has the best spam protection around <br>http://mail.yahoo.com