<DIV>Hello Jim,</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>Thanks for your reply.&nbsp; I just checked implementation of&nbsp; GrayscaleFilleholeImageFilter<FONT face=Verdana color=#0000ff>, and it uses Erosion operation that uses some structuring element.&nbsp; So, I am little confused.&nbsp; </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Verdana color=#0000ff></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Verdana color=#0000ff>Thanks,</FONT><FONT face=Verdana color=#0000ff>Neha</FONT></DIV>
<DIV><BR><B><I>"Miller, James V (Research)" &lt;millerjv@crd.ge.com&gt;</I></B> wrote:</DIV>
<BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1458" name=GENERATOR>
<DIV><SPAN class=026104913-29102004><FONT face=Verdana color=#0000ff size=2>A reference to the FillHole technique is mentioned in the documentation.&nbsp; The excerpt is below.</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=026104913-29102004><FONT face=Verdana color=#0000ff size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=026104913-29102004><FONT face=Verdana color=#0000ff size=2>&nbsp;* Geodesic morphology and the Fillhole algorithm is described in<BR>&nbsp;* Chapter 6 of Pierre Soille's book "Morphological Image Analysis:<BR>&nbsp;* Principles and Applications", Second Edition, Springer, 2003.<BR></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=026104913-29102004><FONT face=Verdana color=#0000ff size=2>The GrindPeak algorithm is essentially the dual of this algorithm. (Though not mentioned in the above text).</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=026104913-29102004><FONT face=Verdana color=#0000ff size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=026104913-29102004><FONT face=Verdana color=#0000ff size=2>These techniques use geodesic morphology.&nbsp; There is no structuring element to change.&nbsp; They operate on the 4/8 connected neighbors and run iteratively until convergence.</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=026104913-29102004><FONT face=Verdana color=#0000ff size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=026104913-29102004><FONT face=Verdana color=#0000ff size=2>Jim</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=026104913-29102004><FONT face=Verdana color=#0000ff size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=026104913-29102004><FONT face=Verdana color=#0000ff size=2>&nbsp;</DIV></FONT></SPAN>
<BLOCKQUOTE>
<DIV class=OutlookMessageHeader dir=ltr align=left><FONT face=Tahoma size=2>-----Original Message-----<BR><B>From:</B> neha k [mailto:itkneha1@yahoo.com]<BR><B>Sent:</B> Thursday, October 28, 2004 4:11 PM<BR><B>To:</B> Luis Ibanez; itkneha1@yahoo.com<BR><B>Subject:</B> Examples on GrayScaleFillHoleImageFiler? And using breast images on mypacs.net<BR><BR></FONT></DIV>
<DIV>Hello Luis,</DIV>
<DIV>Thanks for your reply.&nbsp;&nbsp; Is there any example on GrayScaleFillHoleImageFiler or GrayScaleGrindPeakImageFilter?&nbsp;&nbsp; What book can I refer to understand these filters?</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>Also,&nbsp;can you please let me know what you mean by&nbsp;"fine tune the structuring<BR>element for matching the relative size of calcifications in&nbsp;image".&nbsp;&nbsp; </DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>Since I need pair of breast MRIs (Which unfortunately&nbsp;are not avilable to me) I checked mypacs.net, where&nbsp;I found one set of images GRE-images at following link - <A href="http://www.mypacs.net/cgi-bin/repos/mpv3_repo/wrm/repo-view.pl?cx_subject=28078&amp;cx_image_only_mode=off&amp;cx_repo=mpv3_repo&amp;cx_from_folder">http://www.mypacs.net/cgi-bin/repos/mpv3_repo/wrm/repo-view.pl?cx_subject=28078&amp;cx_image_only_mode=off&amp;cx_repo=mpv3_repo&amp;cx_from_folder</A>=</DIV>
<DIV>Fil. 9,10 and 11.&nbsp;&nbsp; Does it make sense to use these 2 images, subtracting them and applying Watershed on the result.&nbsp; If so, how can I decide by checking these images if that needs deformable registration?</DIV>
<DIV>Any input on this is most appreciated.&nbsp; </DIV>
<DIV>Thanks,</DIV>
<DIV>Neha</DIV>
<DIV><BR><B><I>Luis Ibanez &lt;luis.ibanez@kitware.com&gt;</I></B> wrote:</DIV>
<BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid"><BR>HI Neha,<BR><BR>You can find Breat images at<BR><BR>www.mypacs.net<BR><BR>you can create an account for free and<BR>download real datasets.<BR><BR>Look for the title "Shared Cases" and<BR>click in "Breast".<BR><BR>--<BR><BR>You may want try the advanced Mathematical Morphology<BR>methods such as: FillHole and GrindPeak.<BR><BR>http://www..itk.org/Insight/Doxygen/html/classitk_1_1GrayscaleFillholeImageFilter.html<BR>http://www.itk.org/Insight/Doxygen/html/classitk_1_1GrayscaleGrindPeakImageFilter.html<BR><BR>Taking an input imag, applying one of these filter and<BR>then subtracting from the original may enhance spiculations<BR>and calcificaitions. You will have to fine tune the structuring<BR>element for matching the relative size of calcifications in your<BR>image.<BR><BR><BR>Regards,<BR><BR><BR>Luis<BR><BR>----------------------------<BR>neha k wrote:<BR><BR>&gt; Hello
 All,<BR>&gt; <BR>&gt; I am working on Breast Image Segmention for deleneating lesions, ducts <BR>&gt; and fat tissues. Problem is that I don't have Breast Images with <BR>&gt; contrast agent used. Hence I can't have pre and post contrast agent <BR>&gt; to subtract them and locate tumour etc. What will be the best way to <BR>&gt; segment such breast images (in RAW format). I am currently trying to <BR>&gt; use Watershed segmentation and not getting any good results with it. <BR>&gt; It causes lot of oversegmentation. I have not used Level Set Seg. <BR>&gt; method yet.<BR>&gt; Any input is appreciated. <BR>&gt; <BR>&gt; Thanks,<BR>&gt; Neha<BR>&gt;<BR>&gt;<BR><BR><BR><BR></BLOCKQUOTE>
<P>
<HR SIZE=1>
Do you Yahoo!?<BR>Yahoo! Mail - CNET Editors' Choice 2004. <A href="http://reviews.cnet.com/Yahoo_Mail/4852-9236_7-30980704.html?part=editchoice">Tell them what you think</A>. </BLOCKQUOTE></BLOCKQUOTE><p>
                <hr size=1>Do you Yahoo!?<br>
<a href="http://us.rd.yahoo.com/mail_us/taglines/aac/*http://promotions.yahoo.com/new_mail/static/ease.html">Yahoo! Mail Address AutoComplete</a> - You start. We finish.