<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=gb2312">
<META content="MSHTML 6.00.2900.2912" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV><FONT face=Verdana size=2>Hi, Patrick,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Verdana size=2></FONT> </DIV>
<DIV><FONT face=Verdana size=2>Thank you for your help on the object disappering 
during tracking. I will try the code later.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Verdana size=2></FONT> </DIV>
<DIV>Today I found another problem, here is a head phantom scanned with CT 
gantry tilt.</DIV>
<DIV>The angle is</DIV>
<DIV>(0018|1120) Gantry/Detector Tilt = 6.68</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>so IGSTK will not read this set of DICOM.</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>I see there is  several DICOM sets with gantry tilt in 
Sandbox\Testing\Data\CT_WITH_GANTRYTILT,</DIV>
<DIV>E000147_1, E000147_2, E000147_4 can be read by NeedleBiopsy app, whose 
angle is</DIV>
<DIV>-16.5, -6.5, -1.5 separately.</DIV>
<DIV>But E000147_3, E000147_5, E000147_6 can not be read, whose angle is</DIV>
<DIV>6.5, 10.5,  20.5 separately.</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>I do not know why the gantry tilt with positive angle can not be read, 
while the one with negative</DIV>
<DIV>angle can be read into IGSTK. It seems that the shear transform should be 
corrected in either positive</DIV>
<DIV>angle or negative angle. Is that a bug in 
igstkDICOMImageReader.txx around line 593-607 ?</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>  // Check if the gantry tilt is within an acceptable 
range<BR>    double gantryTilt;<BR>    double 
gantryTiltThreshold=0.01;<BR>  <BR>    std::stringstream 
sstr;<BR>    sstr.str( m_GantryTilt );<BR>    sstr 
>> gantryTilt;</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>    if( gantryTilt > gantryTiltThreshold 
)<BR>      {<BR>      
this->m_ImageReadingErrorInformation = "Unacceptable gantry 
tilt";<BR>      this->m_StateMachine.PushInput( 
this->m_ImageReadingErrorInput );<BR>      
this->m_StateMachine.ProcessInputs();<BR>      
return; <BR>      }</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>And due to affine transform is needed to correct gantry tilt, should the 
gantry tilted CT images</DIV>
<DIV>be read or not be read into IGSTK before correction?</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Thank you very much!</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Fucang</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV></BODY></HTML>