<div dir="ltr">Hi Tommi,<div><br></div><div>If those images are CT, it might be that the pixelvalues are converted to Hounsfield units: the pixelvalues are shifted so that 'air' equals -1000. Using the reader with <b>signed short</b> would then solve your problem.</div><div><br></div><div>Greetings,</div><div>Lambert</div></div><div id="DDB4FAA8-2DD7-40BB-A1B8-4E2AA1F9FDF2"><br>
<table style="border-top:1px solid #aaabb6">
        <tr>
      <td style="width:55px;padding-top:18px"><a href="https://www.avast.com/sig-email?utm_medium=email&utm_source=link&utm_campaign=sig-email&utm_content=webmail&utm_term=oa-2115-v2-b" target="_blank"><img src="https://ipmcdn.avast.com/images/2016/icons/icon-envelope-tick-round-orange-v1.png"></a></td>
                <td style="width:470px;padding-top:20px;color:#41424e;font-size:13px;font-family:Arial,Helvetica,sans-serif;line-height:18px">Virus-free. <a href="https://www.avast.com/sig-email?utm_medium=email&utm_source=link&utm_campaign=sig-email&utm_content=webmail&utm_term=oa-2115-v2-b" target="_blank" style="color:#4453ea">www.avast.com</a>
                </td>
        </tr>
</table><a href="#DDB4FAA8-2DD7-40BB-A1B8-4E2AA1F9FDF2" width="1" height="1"></a></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Mar 28, 2016 at 5:45 AM, penitentepid epid <span dir="ltr"><<a href="mailto:penitentepid@gmail.com" target="_blank">penitentepid@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div>Hi, ITK group<br><br></div>I have bunch of 12 bits dicom images whose intensity ranges from 0 to 4095. (found in dicom header, bitsStoed =12, highBits = 11, pixel representation = 0)<br></div>when i used image reader <unsigned short,2>, i got a image whose pixel intensity are ranging from 0 to 65535. why does this happen? i mean i understand unsigned short is in this range, but did itk internally rescale image intensity somehow?<br><br></div>why not put highest of pixel intensity as it suppose to be (4095 in this case), and leave rest bits to be zeroes..<br><br></div>tommi.<br></div>
<br>_______________________________________________<br>
Community mailing list<br>
<a href="mailto:Community@itk.org">Community@itk.org</a><br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/community" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/community</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>