<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Hi Zein,</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">PET/CT slices are just two DICOM series. Extract PET series and write it as .mha or .nrrd file, and then do the same for CT series. And then those 2 images are a PET/CT pair. You can also use <a href="https://github.com/InsightSoftwareConsortium/ITKExamples/blob/master/src/IO/DICOM/DicomSeriesReadImageWrite3/Code.cxx">DicomSeriesReadImageWrite3</a>.</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Regards,</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Dženan</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Nov 24, 2015 at 6:47 AM, Zein Salah <span dir="ltr"><<a href="mailto:zeinsalah@gmail.com" target="_blank">zeinsalah@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Thanks Matt!<br>
<br>
This was not exactly the question. I already import dicom into itk. My<br>
question was whether itk can import/extract pet data from pet-ct<br>
slices.<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
<br>
2015-11-24 11:47 GMT+01:00 Matt McCormick <<a href="mailto:matt.mccormick@kitware.com">matt.mccormick@kitware.com</a>>:<br>
> Hi Zein,<br>
><br>
> Yes, ITK can read DICOM files.  See this example:<br>
><br>
><br>
> <a href="http://www.itk.org/Doxygen/html/Examples_2IO_2DicomSeriesReadImageWrite2_8cxx-example.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.itk.org/Doxygen/html/Examples_2IO_2DicomSeriesReadImageWrite2_8cxx-example.html</a><br>
><br>
> HTH,<br>
> Matt<br>
><br>
> On Tue, Nov 24, 2015 at 4:49 AM, Zein Salah <<a href="mailto:zeinsalah@gmail.com">zeinsalah@gmail.com</a>> wrote:<br>
>><br>
>> Hi,<br>
>><br>
>> I have some PET-CT datasets that I can open, e.g., using DicomWorks.<br>
>> Is is actually possible to import such data in ITK? I would like to be<br>
>> able<br>
>> to load PET and CT data separately. Is there an example<br>
>> for this?<br>
>><br>
>> Much thanks,<br>
>> Zien<br>
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