<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Your solution will depend on what positions are assigned to images arising from different coils. I suspect you will have to manipulate position and orientation. Take a look at this example and links therein:</div><div class="gmail_default" style=""><font face="verdana, sans-serif"><a href="http://itk.org/ITKExamples/src/Filtering/ImageGrid/AppendTwo3DVolumes/Documentation.html">http://itk.org/ITKExamples/src/Filtering/ImageGrid/AppendTwo3DVolumes/Documentation.html</a></font><br></div><div class="gmail_default" style=""><font face="verdana, sans-serif"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font face="verdana, sans-serif">HTH</font></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Nov 2, 2015 at 3:03 PM, lucky via Insight-users <span dir="ltr"><<a href="mailto:insight-users@itk.org" target="_blank">insight-users@itk.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">I have a data set of MRI DICOM images that was scanned using Torso/Body Coil.<br>
We used multiple slabs of the coil to scanned the full arm. In the finalized<br>
data, we have the overlapped region/images of sequences, we want to remove<br>
those overlapped images from the data set. Of course, we will want to use<br>
the high quality image and discard the noisy one if there is a overlap of<br>
two.<br>
<br>
My first question is,<br>
<br>
How can we distinguish the overlapped image from the DICOM data set? There<br>
is one metadata "0020|0032 "Image Position Patient" that can be used for<br>
this, but is there anything else that I can use?<br>
<br>
My second question is,<br>
<br>
Is there any way/algorithm in ITK that can remove/delete the overlapped<br>
images and save after that as new data set? I would also need to rearrange<br>
the "vtkImageData*" in order to visualize the final data set without any<br>
overlapped regions?<br>
<br>
third question,<br>
<br>
Is there anything similar to what I want to achieve in 3D Slicer 4.4.<br>
<br>
I have my own visualizer that is written in C++, ITK, VTK, so it would be<br>
great if I can use something from ITK. Can anyone point me out what features<br>
of ITK do I need to consider to remove/delete overlapped images and save the<br>
remaining images as a new data set? I am also confused about what images do<br>
I need to remove Axial only? Images were scanned as Axial.<br>
<br>
Thanks,<br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
View this message in context: <a href="http://itk-insight-users.2283740.n2.nabble.com/How-can-I-remove-overlapped-MRI-DICOM-images-from-the-data-tp7588120.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://itk-insight-users.2283740.n2.nabble.com/How-can-I-remove-overlapped-MRI-DICOM-images-from-the-data-tp7588120.html</a><br>
Sent from the ITK Insight Users mailing list archive at Nabble.com.<br>
_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/insight-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
</blockquote></div><br></div>