I have a rough segmentation (marked with 1 value) and the background is 0. Should i change the background to sth else and it will work? Cos now the result of the watershedfrommarker is image with full of 1 values. <div><br></div><div>Thanks for your time!<br><br>On Wednesday, July 8, 2015, Richard Beare <<a href="mailto:richard.beare@gmail.com">richard.beare@gmail.com</a>> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">The watershedfrommarker requires seed regions. The trick is that you need at least two - one for the thing you want to segment and one for everything else. The seeds are regions in the marker image. </div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jul 9, 2015 at 6:25 AM, András Osztroluczki <span dir="ltr"><<a href="javascript:_e(%7B%7D,'cvml','ahnryka@gmail.com');" target="_blank">ahnryka@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello ITK users!<div><br></div><div>Is there any way to aid the watershed segmentation (watershed, morph watershed, morphwatershedfrommarker) with user defined seed region ?</div><div><br></div><div>Thanks and Regards,</div><div>Andras</div></div>
<br>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://public.kitware.com/mailman/listinfo/insight-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://public.kitware.com/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</blockquote></div>