<html>

  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">

    Hi all,<br>

    <br>

    Is there a way to use some existing code to handle <tt>nifticlib</tt>

    <tt>nifti_image</tt> objects in memory from within ITK, essentially

    treating them as instances of <tt>ITK::Image</tt>?<br>

    <br>

    I've been given the task of interfacing some ITK(-based) code with

    some non-ITK(-based) code. The non-ITK code uses <tt>nifticlib

      nifti_image</tt> objects to represent image data. We would like

    the ITK code to manipulate this image data (in memory, without

    writing the images to disk each time - otherwise we could just use

    ITK's reader for NIFTI images).<br>

    <br>

    I found the <a

      href="http://www.itk.org/CourseWare/Training/GettingStarted-V.pdf"><em>Getting

        Started V: Integrating ITK in your Application</em></a> slides

    very helpful: they seem to describe quite well how to pass image

    data between ITK and non-ITK code. However, the image orientation

    and other meta-data will need to be handled more or less manually,

    in general.<br>

    <br>

    However, it looks like much of this same work is done by the <tt>itk::NiftiImageIO</tt>

    object, using <tt>nifticlib</tt> to read NIFTI images from disk,

    then turning the resulting <tt>nifti_image</tt> into an <tt>ITK::Image</tt>.

    However, I don't know how easy it would be to re-use this code in a

    sustainable way.<br>

    <br>

    Thanks in advance,<br>

    Ben <br>

    <pre class="moz-signature" cols="72">-- 

EngD Doctoral Student

Centre for Medical Image Computing

University College London

Room 3.01 Engineering Front Building

Malet Place

London WC1E 7JE

United Kingdom

</pre>

  </body>

</html>