<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style id="owaParaStyle">P {
        MARGIN-BOTTOM: 0px; MARGIN-TOP: 0px
}
</style>
</head>
<body fPStyle="1" ocsi="0">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">
<p>Dear ITK users, </p>
<p> </p>
<p>just to further motivate your intervention, Nirmal and I are trying to track 2D contours at different longitudinal coordinates in order to stack atlas slices as well as interpolate between them between consecutive slices. Any deformation that we do has to
 deal with topological variation as well as produce a deformation function that can be interpolated based on fractional values of these function values.
</p>
<p> </p>
<p>Thanks for your kind consideration. </p>
<p> </p>
<p>Michel</p>
<div>
<p> </p>
<div><font size="2" face="Tahoma">Michel Audette, Ph.D. </font></div>
<div><font size="2" face="tahoma">Assistant Professor,</font></div>
<div><font size="2" face="tahoma">Department of Modeling, Simulation and Visualization Engineering,</font></div>
<div><font size="2" face="tahoma">Old Dominion University,</font></div>
<div><font size="2" face="Tahoma">Norfolk, VA.</font></div>
<div><font size="2" face="tahoma"></font> </div>
</div>
<div style="FONT-SIZE: 16px; FONT-FAMILY: Times New Roman; COLOR: #000000">
<hr tabindex="-1">
<div id="divRpF5901" style="DIRECTION: ltr"><font color="#000000" size="2" face="Tahoma"><b>From:</b> Insight-users [insight-users-bounces@itk.org] on behalf of Nirmal Patel [npate012@odu.edu]<br>
<b>Sent:</b> Monday, May 25, 2015 9:41 PM<br>
<b>To:</b> insight-users@itk.org<br>
<b>Subject:</b> [Spam:7.0 SpamScore] [ITK-users] Registration of images with varying topology<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div dir="ltr">Dear ITK users,
<div><br>
</div>
<div>I would like to perform registration on two images with varying topology. I have tried the diffeomorphic demons filter to do this. Can someone please tell me how to calculate which pixel in the fixed image corresponds to which pixel in the moving image?
 I do not understand how to use the displacement field generated by the diffeomorphic demons filter.</div>
<div><br>
</div>
<div>Thank you.</div>
<div><br>
</div>
<div>Sincerely,</div>
<div>Nirmal</div>
<div><br>
</div>
</div>
<div><span style="FONT-SIZE: medium; FONT-WEIGHT: normal; COLOR: black; FONT-STYLE: normal; DISPLAY: inline; BACKGROUND-COLOR: white">
<hr>
<br>
<a href="https://www.spamtrap.odu.edu/canit/b.php?i=03OwpH2U5&m=3af3446b889c&t=20150525&c=s" target="_blank">Spam</a><br>
<a href="https://www.spamtrap.odu.edu/canit/b.php?i=03OwpH2U5&m=3af3446b889c&t=20150525&c=n" target="_blank">Not spam</a><br>
<a href="https://www.spamtrap.odu.edu/canit/b.php?i=03OwpH2U5&m=3af3446b889c&t=20150525&c=f" target="_blank">Forget previous vote</a><br>
</span></div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>