
<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=us-ascii"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">Hello,<div><br></div><div>This is likely due to how you are defining a binary image.</div><div><br></div><div>SimpleITK has the established convention that for binary images/ masks, that 0 are the background and 1 is the foreground [1]. This is reflected in the default parameters of many filters, including the binary morphological filters.</div><div><br></div><div>Most likely you need to check the value of the ForegroundValue.</div><div><br></div><div>HTH,</div><div>Brad</div><div><br></div><div>[1] <a href="http://www.itk.org/SimpleITKDoxygen/html/ConventionsPage.html">http://www.itk.org/SimpleITKDoxygen/html/ConventionsPage.html</a></div><div><br><div><div>On May 7, 2015, at 11:10 AM, Wookyung An <<a href="mailto:aqualiquid1@gmail.com">aqualiquid1@gmail.com</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8000001907349px">Hi ITK users, </span><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">I am pretty fresh of SimpleItk. I tried to use BinaryMorphologicalClosing to filter some noises that are smaller than the structuring element. I noticed that the default kernel type is "ball" which is ok. However, after I applied the function, there is no change at all.</div><div style="font-size:12.8000001907349px">For example, I tried to filter which smaller than 10(radius).</div><div style="font-size:12.8000001907349px"><p><b>after_morp = SimpleITK.BinaryMorphologicalClosing(binarized_img, 10); </b></p><p><br></p><p>But I found that nothing changed at all. Do you have any idea what was the problem?</p><p><br></p><p>Thank you in advance.</p></div><div><br></div>

</div>

_____________________________________<br>Powered by <a href="http://www.kitware.com">www.kitware.com</a><br><br>Visit other Kitware open-source projects at<br><a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br><br>Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>http://www.kitware.com/products/protraining.php<br><br>Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ<br><br>Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>http://public.kitware.com/mailman/listinfo/insight-users<br></blockquote></div><br></div></body></html>