<div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>We are currently writing a conversion from a third party image format to the ITK format. For that we need to correctly set the image origin and direction matrix.</div><div><br></div><div>When directly reading DICOM images in ITK, (according to the code) they are ordered in such a way that the coordinate system is right handed, i.e. the columns of the direction matrix form a right handed coordinate system. Also the Doxygen of SetDirection says the direction matrix columns should form a right handed coordinate system.</div><div><br></div><div>In the image we get from the third party system (in memory) the DICOM slices are not reordered, which means the coordinate system might be left handed instead of right handed. We currently accommodate for this by setting the right direction matrix, which seems to work fine, but also seems to be illegal according to the Doxygen comment of SetDirection.</div><div><br></div><div>Is there any issue that can occur when following our approach? We would rather not reorder the data, but just use the voxel data from the third party system as is.</div><div><div><br></div><div>Kind regards,</div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><font color="#000000"><span style="font-family:arial;font-size:small">Coert Metz, PhD</span></font><div><div dir="ltr"><div style="font-size:small;font-family:arial"><font color="#000000">Research & Development Engineer  |  <a href="http://www.quantib.com/" target="_blank">Quantib B.V.</a></font></div><div style="font-size:small;font-family:arial"><div><font color="#000000"><a href="mailto:c.metz@quantib.com" target="_blank">c.metz@quantib.com</a>  |  +31 650 68 60 28</font></div></div></div></div></div></div>
</div></div>

<br>
<font face="Arial, Helvetica, sans-serif" size="1" style="background-color:white">This message may contain confidential or privileged information. If you are not the addressee, please notify the sender and delete it from your files.</font>