<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="EN-US" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hello,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I was wondering if it would be possible to get information of exactly how the deformable registration field is defined, specifically for the daemons filter.  Assuming we have a fixed CT and a moving CT of the same number of pixels in each
 dimension, the deformable field could be defined as<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">‘To deformation field’<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">For each voxel in moving CT, the vectors point to the location this voxel should be mapped in the fixed CT<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Or<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">‘From deformation field’<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">For each voxel in fixed CT, the vector points to the location in the moving CT from which we should grab and place here<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">In addition, each of these could be defined as either +/- depending on how you define the starting location of the pixel shifts.  I am generating these deformation fields and saving them as VTK files, then applying them in my own implementation. 
 I have switched definitions and tried multiple ways to apply the deformation field, and no single method produces a result that is obviously correct or obviously wrong.  Any information on how the deformation field is actually defined would be appreciated. 
 Thanks<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">James Armstrong, Ph.D.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">PostDoctoral Fellow, Physics<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Department of Radiation Oncology<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">University of Colorado School of Medicine<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">1665 Aurora Ct, MS F706<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Aurora, CO 80045<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">720-848-0257<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
</body>
</html>