<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=windows-1252"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">Hello,<div><br></div><div>What is you platform, architecture and are you using the ITK provided HDF5? How are you compiling ITK Debug Release?</div><div><br></div><div>If you use a system version of HDF5 do you still get the issue?</div><div><br></div><div>Is there an issue will all HDF5 files your just this one? Can you share the problematic file?</div><div><br></div><div>Brad</div><div><br></div><div><br><div><div>On May 9, 2014, at 2:23 PM, Chris Cooper <<a href="mailto:chris.cooper@veranmedical.com">chris.cooper@veranmedical.com</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; font-size: 14px; font-family: Calibri, sans-serif;">
<div>While trying to read a file, we get a crash with this call stack:</div>
<div>H5MM_xfree</div>
<div>H5E_<span style="font-style: italic;">printf_</span>stack</div>
<div>H5E_<span style="font-style: italic;">clear_</span>stack</div>
<div>H5Fis_hdf5</div>
<div>H5::H5File::isHdf5</div>
<div>HDF5ImageIO::CanReadFile</div>
<div>ImageIOFactory::CreateImageIO</div>
<div>ImageFileReader<…>::GenerateOutputInformation</div>
<div>ProcessObject::UpdateOutputInformation</div>
<div>ImageBase<3>::UpdateOutputInformation</div>
<div>DataObject::Update</div>
<div>ProcessObject::Update</div>
<div><br>
</div>
<div>The code that calls itk looks like this:</div>
<div><div style="margin: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;"><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"></span>ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();</div><div style="margin: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">        reader->DebugOff();</div><div style="margin: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">        reader->SetGlobalWarningDisplay(<span style="color: #bb2ca2">false</span>);</div><div style="margin: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">        reader->SetFileName(cache.pathForUid(uid).string());</div><div style="margin: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">        reader->Update();</div><div style="margin: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;"><br>
</div>
</div>
<div>This looks similar to an issue discussed here:</div>
<div><a href="http://www.itk.org/pipermail/insight-users/2013-November/049157.html">http://www.itk.org/pipermail/insight-users/2013-November/049157.html</a></div>
<div><br>
</div>
<div>Any thoughts on this problem?  Is there a chance it’s been solved in 4.5.2 (which I am downloading & building now)?</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks,</div>
<div>Chris</div>
<div><br>
</div>
</div>

_______________________________________________<br>Community mailing list<br><a href="mailto:Community@itk.org">Community@itk.org</a><br>http://public.kitware.com/cgi-bin/mailman/listinfo/community<br></blockquote></div><br></div></body></html>