<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 14px; font-family: Calibri, sans-serif;">
<div>The way I used DCMTK to read the images, I thought I was using an interface that already applied slope/intercept.</div>
<div><br>
</div>
<div>If that isn’t the case, itkDCMTKImageIO needs to be fixed.  If you can supply a dataset illustrating the problem, I can work on that.</div>
<div><br>
</div>
<div>In the meantime, the only workaround I can suggest is to use the irk::DCMTKFileReader class to open the slices and recover the Slope/Intercept.  You can then use ITK filters to apply them after reading in the Image.</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<span id="OLK_SRC_BODY_SECTION">
<div style="font-family:Calibri; font-size:11pt; text-align:left; color:black; BORDER-BOTTOM: medium none; BORDER-LEFT: medium none; PADDING-BOTTOM: 0in; PADDING-LEFT: 0in; PADDING-RIGHT: 0in; BORDER-TOP: #b5c4df 1pt solid; BORDER-RIGHT: medium none; PADDING-TOP: 3pt">
<span style="font-weight:bold">From: </span>Jose Ignacio Prieto <<a href="mailto:joseignacio.prieto@gmail.com">joseignacio.prieto@gmail.com</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Date: </span>Tuesday, May 6, 2014 at 5:53 PM<br>
<span style="font-weight:bold">To: </span>Insight <<a href="mailto:insight-users@itk.org">insight-users@itk.org</a>>, Mushly McMushmaster <<a href="mailto:norman-k-williams@uiowa.edu">norman-k-williams@uiowa.edu</a>><br>
<span style="font-weight:bold">Subject: </span>Slope intercept on DCMTK-ITK not working<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>
<div dir="ltr">Hi all, 
<div><br>
</div>
<div><br>
<div><br>
<div>This question is mainly aimed for Kent, but maybe somebody else knows too.</div>
<div><br>
</div>
<div>I am trying to load a 4D flow dataset acquired on a Phillips system. On the Z slices first there are the anatomical slices, time sorted (68 z slices on 25 time frames = 1700), and then are the per axis velocities (again 1700 slices). </div>
<div><br>
</div>
<div>So these image has two different slope-intercept functions, one for the anatomical and another for velocity. Using itkDCMTKImageIO and itkDCMTKFileReader there is no clue on where are this values read. Checking the output with an iterator I see that the
 slope and intercept are not considered at any time. </div>
<div><br>
</div>
<div>Is this something that DCMTK should do by itself? If I force it to look for it on itkDCMTKImageIO, what is the internal helper I should modify? </div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks in advance for your help,</div>
<div><br>
</div>
<div>Ignacio Prieto</div>
<div>
<div><br>
</div>
-- <br>
José Ignacio Prieto<br>
Software Developer</div>
<div>Biomedical Imaging Center</div>
<div>Pontificia Universidad Catolica de Chile.</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</span><br>
<br>
<hr>
Notice: This UI Health Care e-mail (including attachments) is covered by the Electronic Communications Privacy Act, 18 U.S.C. 2510-2521, is confidential and may be legally privileged.  If you are not the intended recipient, you are hereby notified that any
 retention, dissemination, distribution, or copying of this communication is strictly prohibited.  Please reply to the sender that you have received the message in error, then delete it.  Thank you.
<hr>
</body>
</html>