<div dir="ltr">FYI,<div><br></div><div>Here is a submission with system HDF5 but with Fedora 20. I think package is similar in RHEL</div><div><br></div><div><a href="http://open.cdash.org/buildSummary.php?buildid=3316792">http://open.cdash.org/buildSummary.php?buildid=3316792</a><br>

</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 7, 2014 at 1:31 PM, Matt McCormick <span dir="ltr"><<a href="mailto:matt.mccormick@kitware.com" target="_blank">matt.mccormick@kitware.com</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Brad,<br>
<br>
On Ubuntu 12.04, there appears to be a number of HDF5 "-dev" packages:<br>
<br>
libhdf5-lam-dev<br>
libhdf5-mpi-dev<br>
libhdf5-mpich-dev<br>
libhdf5-openmpi-dev<br>
libhdf5-serial-dev<br>
<br>
Which one are you using?<br>
<br>
Thanks,<br>
Matt<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Wed, May 7, 2014 at 1:23 PM, Matt McCormick<br>
<<a href="mailto:matt.mccormick@kitware.com">matt.mccormick@kitware.com</a>> wrote:<br>
> Hi Brad,<br>
><br>
> It looks like our code coverage for the HDF TransformIO is pretty good<br>
> [1], but I do not see a dashboard submission for those platforms that<br>
> use a system HDF5.  I will set one up on faraway.kitware and try to<br>
> reproduce the SimpleITK test failure.<br>
><br>
> Thanks,<br>
> Matt<br>
><br>
> [1] <a href="http://lorensen.github.io/VTKCodeCoverage/ITK/IO/TransformHDF5/src/index.html" target="_blank">http://lorensen.github.io/VTKCodeCoverage/ITK/IO/TransformHDF5/src/index.html</a><br>
><br>
> On Wed, May 7, 2014 at 8:59 AM, Bradley Lowekamp <<a href="mailto:blowekamp@mail.nih.gov">blowekamp@mail.nih.gov</a>> wrote:<br>
>> Hello,<br>
>><br>
>> I wrote some SimpleITK tests to write out HDF5 transforms. They are failing when using ITK built with system HDF5. Specifically with RHEL5 and Ubuntu 12.04. I believe this is a critical issue as it's how ITK is being built for Linux distributions.<br>


>><br>
>> Looking through my ITK nightly build testing directory I didn't see any hdf5 files which leads me to believe this IO transform format may not be well tested.<br>
>><br>
>> I would greatly appreciate some assistance on this issue.<br>
>><br>
>> Here is my related SimpleITK issue.<br>
>> <a href="https://issues.itk.org/jira/browse/SIMPLEITK-535" target="_blank">https://issues.itk.org/jira/browse/SIMPLEITK-535</a><br>
>><br>
>> Thanks,<br>
>> Brad<br>
>><br>
_______________________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-developers" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-developers</a><br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Regards,<br>   Rashad</font></div>
</div>