<div dir="ltr"><div><div>Hi List<br><br></div>I recently took part in the 3d microscopy grand challenge.  <a href="http://bigwww.epfl.ch/deconvolution/challenge/" target="_blank">http://bigwww.epfl.ch/deconvolution/challenge/</a><br>
<br></div>
<div>One of the big issues was non-circulant boundary conditions. <br><a href="http://bigwww.epfl.ch/deconvolution/challenge/index.html?p=documentation/theory/forwardmodel" target="_blank">http://bigwww.epfl.ch/deconvolution/challenge/index.html?p=documentation/theory/forwardmodel</a><br>

<br></div><div>The contest is over but I was wondering if anybody participated using ITK??  If so how did you deal with the boundary??<br><br></div><div>I
 used a non-circulant deconvolution algorithm (similar to the examples 
provided by the organizers with some modifications for noise handling) 
and it really seems to work well.  So I was interested in running 
comparisons.   ITK seems like a good option for that since it has a few different algorithm implementations. <br>
<br></div><div>Any suggestions??  So far I tried Richardson Lucy with 
Neumann boundary as a comparison.  Any other suggestions?  Any other 
parameters I should play with??  Is it possible to fade the extended 
pixels somehow??<br>
</div><br>Thanks</div>